蛋白质指纹图谱技术的临床应用VIP免费

19MenendezJA,MehmiI,GriggsDW,etal.TheangiogenicfactorCYR61inbreastcancer:molecularpathologyandtherapeuticperspectives.EndocrRelatCancer,2003,10:1412152.20LinMT,ChangCC,ChenST,etal.Cyr61expressionconfersresistancetoapoptosisinbreastcancerMCF27CellsbyamechanismofNF2ϑB2dependentXIAPup2regulation.JBiolChem,2004,279(23):24015224023.21SchimmerAD,WelshK,PinillaC,etal.Small2moleculeantagonistsofapoptosissuppressorXIAPexhibitbroadantitumoractivity.CancerCells,2004,5(1):25235.22BerezovskayaO,SchimmerAD,GlinskiiAB,etal.IncreasedexpressionofapoptosisinhibitorproteinXIAPcontributestoanoikisresistanceofcirculatinghumanprostatecancermetastasisprecursorcells.CancerRes,2005,65(6):237822386.23CarterBZ,GrondaM,WangZ,etal.Small2moleculeXIAPinhibitorsderepressdownstreameffectorcaspasesandinduceapoptosisofacutemyeloidleukemiacells.Blood,2005,105(10):404324050.24KimEH,KimSU,ShinDY,etal.RoscovitinesensitizesgliomacellstoTRAIL2mediatedapoptosisbydownregulationofsurvivinandXIAP.Oncogene,2004,23:4462456.25KimEH,KimSU,ChoiKS.RottlerinsensitizesgliomacellstoTRAIL2inducedapoptosisbyinhibitionofCdc2andthesubsequentdownregulationofsurvivinandXIAP.Oncogene,2005,24(5):8382849.26SlivaS,RizzoMT,EnglishD.Phosphatidylinositol32KinaseandNF2ϑBregulatemotilityofinvasiveMDA2MB2231humanbreastcancercellsbythesecretionofurokinase2typeplasminogenactivator.JBiolChem,2002,277:315023157.(收稿日期:2005204220)·综述·蛋白质指纹图谱技术的临床应用赵艇,高春芳【摘要】蛋白质组学相关技术研究尤其是蛋白质指纹谱SELDI2TOF2MS技术在临床医学中具有广阔的应用前景,本文介绍了该技术的特点及分析步骤,简明阐述了目前该技术在临床医学中的应用情况,对其前景进行了展望。【关键词】蛋白质组学;SELDI;质谱;蛋白质芯片;生物标记物作者单位:471031洛阳,解放军第150中心医院全军肛肠外科中心蛋白质作为功能基因的直接体现者,是生命活动和生物结构最主要的承担者。它不仅主导细胞代谢和调控,也是多种致病基因和大多数药物作用靶细胞。随着人类基因组计划的实现,生命科学进入功能基因时代,研究重点也集中在生物功能的整体研究。20世纪90年代中期,产生了一门新兴学科——蛋白质组学(proteomics)[1],它是以细胞内全部蛋白质的存在及其活动方式为研究对象,开辟了生命科学研究进入后基因组时代的新天地,也为临床医学研究提供了全新的技术手段和思维模式。本文就蛋白质组学相关技术研究尤其是蛋白质指纹图谱SELDI2TOF2MS技术及其在临床医学中有关研究情况作一综述。1蛋白质组学研究内容及常用技术蛋白质组学指以蛋白质组为研究对象,从整体角度分析细胞内动态变化的蛋白质组成与活动规律的科学,它研究的是一个细胞或一个基因组所表达的全部蛋白质,是一个在空间和时间上动态变化的整体。蛋白质组学研究主要依赖三大技术,即双向电泳技术、电喷雾质谱(ESI2MS)和基质辅助激光解吸离子飞行时间质谱技术(MALDI2TOF2MS)、生物信息学技术。1.1双向电泳技术双向聚丙烯酰胺凝胶电泳技术(two2dimensionalpolyacrylamidegelelectrophoresis,22DE)是1975年首先由O′Parrell等[2]创立,它将22DE样品经过细胞裂解与蛋白质溶解,除去核酸等非蛋白质成分,利用不同蛋白质等电点和分子量不同的特性,在相互垂直的两个方向上,采取分阶段分离,第一相是等电聚焦电泳,在·683·国外医学外科学分册2005年第32卷第5期SurgeryForeignMedicalSciences,2005,vol32.No.5固定pH梯度胶上进行,蛋白质因等电点不同分离。第二相是十二烷基磺酸钠2聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS2PAGE),蛋白质因分子量不同而分离。其结果可与质谱分析鉴定相匹配,是一种有效的二维分离技术。特别是固相化pH梯度(IPG)的发明与完善,改善了操作的重复性,提高了上样量[3]。通过不同双向电泳技术建立特定组织或细胞的双向电泳数据库,建立蛋白质组图谱,进行专业图像分析。例如在研究肿瘤相关抗...