CELLQUEST软件的使用江苏大学附属医院风湿科李晶〖返回主页〗使用手册学习本章后应能够：�真实血样之3色荧光染色技术�用CellQuest从流式细胞仪收取3色样本�用CellQuest从流式细胞仪分析3色样本�应用Quadrant（象限）产生统计�将统计结果输出?电子表格�应用Region（区）和Gate（门）产生统计1.CELLQuest软件1.1概述CELLQuest软件从流式细胞仪上进行收取和分析数据的通用软件。使用者可藉由CELLQuest软件来从事仪器之调整与设定，可用以进行细胞检品之检验测量，CELLQuest软件同时是细胞仪的数据处理系统内的必要软件。在资料分析方面，CELLQuest软件提供使用者双色或多色分析功能，可以定量各类细胞族群的百分比，细胞受染的荧光强度，也可以制作一维直方图、二维散点图、二维密度图、二维等高线图、及三度空间图谱，并且可作文字处理之中间插图，无需再剪贴拼凑，适用于论文发表，及会议报告使用。CELLQuest软件功能强大且灵活，并与Macintosh的多任务环境完全兼容。分析原始数据所得的统计数据，也可以输出到IBM-PC兼容的软件，例如，EXCEL,PowerPoint,Lotus123,SigmaPlot,进行再统计分析或绘图。1.1.1收取(Acquisition)即收取并储存流式细胞仪上数据的过程。在收取前，需用您的样本来最佳化仪器的条件。1.1.2分析(Analysis)将收取的数据进行进一步分析。在分析时，将读取数据文件，然后可画Region(区)、设置Marker(界限)、和进行统计。在CellQuest中，可画单参数直方图、双参数散点图、密度图和等高图。1.1.3从收取到分析(AcquisitionAnalysis)在CellQuest中，从收取到分析的功能允许在数据收取结束后可从收取图转换到分析图。刚刚收取的数据及在收取时限定的格式出现在图中，如Region,Marker等。1.3.工具板工具板可用来画图、Region,Marker和文字等。点击选择。工具板按钮1.等高图：点击，可画等高图，可自定义图的大小。2.选择：点击，可选择一个或多个目标，进行改大小或移动。3.3维图：点击，可画3维图，可自定义图的大小。4.直方图：点击，可画直方图，可自定义图的大小。5.密度图：点击，可画密度图，可自定义图的大小。6.散点图：点击，可画散点图，可自定义图的大小。7.直方图marker：点击，可在直方图上定位Marker的左边界和右边界。8.象限marker：点击，可在散点图、密度图和等高图上定位marker。9.缩小：点击，然后点击图，将放大图缩小到原大小。10.放大：点击，然后点击图，将缩小图放大到原大小。11.矩形region：点击，然后在散点图、密度图和等高图中点击，然后拖动对角线至所需大小。12.多边形region：点击，然后在散点图、密度图和等高图中点击形成起始点，然后拖动鼠标画出多边形顶点并在起始点处点击完成多边形region。13.直方图region：点击，可在直方图上定位region的左边界和右边界。14.椭圆形region:点击，然后在散点图、密度图和等高图中点击，然后拖动对角线至所需大小。15.箭头：点击，然后在实验文件中点击，拖出直线。16.文本：点击，然后点击定位插入点并编辑文字。17.计算器：如果自动重复计算关闭，点击进行数据复计算。1.3CellQuest的文件：1.3.1FCSlistmode数据文件：是流式细胞仪的标准格式数据文件（FCS2.0）。当AcquisitionControl窗口的Setup前未打√时，进行收取后自动保存的文件格式。该文件含有从流式细胞仪收取的平均2000-10000个细胞数的资料。一个含有4参数10,000细胞数的数据文件若256道分辨率则文件大小?45kb，若1024道分辨率则文件大小?85kb。1.3.2CellQuest实验文件：您设置的图、region、gate、统计(statistics)、markers、文字、?色等都将保存。数据文件不在实验文件中保存。CellQuest实验文件的菜单由File菜单下New、Open、Close、Save及Saveas等(类似MicrosoftWord)。•实验文件可以后打开以恢复收取和分析。•实验文件可以通用模板储存以用于常规收取和分析。除数据文件外所有条件（包括region、gate、statistics）都可以通用模板储存。•在实验文件中，有3种图：收取、分析和收取到分析。一个实验文件可含上述3种图的组合，但收取图不能用来分析，分析图不能用来收取。1.3.3InstrSetting文件：仪器调试实验文件，可...
