第四章实验结果1病原分离鉴定实验1
1PCR结果参照已有的鸭坦布苏病毒检测方法对收集的鸡胚尿囊液进行PCR检测,PCR扩增产物送生物技术公司测序
结果显示,FC1-FC4及YF2样品接种的鸡胚尿囊液中均未检测到禽坦布苏病毒核酸,YF1,YF3和YF4样品接种的鸡胚尿囊液中检测到DTMUV的存在
PCR扩增片段经测序表明与FJMH220株、YY5株及BYD-1株的同源性在99
因YF1,YF3和YF4样品都来源于同一鸭场的同一批鸭,由此将3份样品分离获得的病毒视为同一株病毒,命名为YF株
获得的病毒经蚀斑纯化后,-80℃保存备用
通过RT-PCR扩增出病毒YF株基因组的8个基因片段,琼脂凝胶电泳检测,片段大小与预测基本相符,结果见图1
扩增片段经1%琼脂凝胶纯化回收后,克隆到pEASY-B载体中,随后每个片段挑选3个阳性克隆送生物技术公司测序
图1病毒YF株基因组的扩增M、DNA分子量标尺;1-8、YF毒株基因组各扩增片段1
2序列比对结果序列分析表明,该株病毒全基因组全长10990nt,未出现核苷酸插入或缺失及基因重组的变异情况,与已报道的DTMUV分离株的核苷酸同源性均在98
5%以上,且亲缘关系与当前鸭群中优势病毒亚群非常近
表3坦布苏病毒信息及序列同源性比对结果毒株GenBankID宿主YF株(%)毒株GenBankID宿主YF株(%)核苷酸氨基酸核苷酸氨基酸XHZD/2010JQ595407鸭99
0JXSPJQ920423鸭99
7Shandong1JX965381鸭99
4Du/CH/LSD/110128KC136210鸭98
0FJMH220JQ928189鸭99
6ZJ-6JF459991鸭99
5ZJ-407JQ314464鸭99
0byd1JQ920420鸭99
2YY5JF27048