第1页共8页编号：时间：2021年x月x日书山有路勤为径，学海无涯苦作舟页码：第1页共8页EMBLbiocomputingtutorialsPlantgenomedababasetutorial生物信息学机构NCBIInternationalNucleotideSequenceDatabaseCollaboration.EBIUSDASangerCentre北京大学生物信息学中心数据库信息发布及其它GenBankReleaseNotesdbESTsummaryreportEMBLreleasenotesman?emblDDBJreleasenotesrelnote.htmlEukaryoticpromoterdatabasereleasenotesSwissProtreleasenotesman?swissprotPIRreleasenotesman?pirPRFreleasenotesman?prfPDBSTRreleasenotesman?pdbstrPrositereleasenotesman?prositePDBreleasenotesman?pdb第2页共8页第1页共8页编号：时间：2021年x月x日书山有路勤为径，学海无涯苦作舟页码：第2页共8页KEGGreleasenotesman?pathway核苷酸数据库GenBankdbESTdbSTSdbGSSGenome(NCBI)dbSNPHTGSUniGeneEMBL核苷酸数据库Genome(EBI)向EMBL数据库提交序列DDBJPlantRgenedatabase启动子数据库Eukaryoticpromoterdatabase转录因子数据库FRANSFACooTFD蛋白质数据库第3页共8页第2页共8页编号：时间：2021年x月x日书山有路勤为径，学海无涯苦作舟页码：第3页共8页SWISS-PROT或TrEMBLPIRPRFPDBSTRbfind?pdbstr-todayProsite结构数据库PDBNDBDNA-BindingProteinDatabase.../dnabind/index.htmlNMRNucleicAcidsDatabaseProteinPlusDatabase.../protein/index.htmlSwiss3DimageSCOPCATH酶、代谢和调控路径数据库KEGGEnzymeNomenclatureDatabaseProteinKinaseResource(PKR)LIGANDWIT第4页共8页第3页共8页编号：时间：2021年x月x日书山有路勤为径，学海无涯苦作舟页码：第4页共8页EcoCycUM-BBD多种代谢路径数据库基因调控路径数据库(TRANSPATH)基因组数据库日本水稻基因组数据库(RGP)华大水稻基因组框架图欧洲水稻测序（第12染色体）拟南芥基因组数据库USDADatabaseDemeter’sGenomesRiceGenesRiceBlastDBFlyBaseMouseGenomeInformaticsSaccharomycesGenomeDatabase[url=][/url]多种基因组数据库文献数据库PubMedOMIMAgricola第5页共8页第4页共8页编号：时间：2021年x月x日书山有路勤为径，学海无涯苦作舟页码：第5页共8页关键词为基础的数据库检索EntrezEntrezNucleotideSequenceSearchEntrezProteinSequenceSearchBatchEntrezSequenceRetrievalSystem,IndiaSequenceRetrievalSystem,SingaporeSequenceRetrievalSystem,USSequenceRetrievalSystem,UKGetEntryNucleotide&ProteinSequenceSearchDatabaseSearchwithKeyWordsDBGET/LinkDB序列为基础的数据库检索BLASTFASTABLITZSSearchElectronicPCRProteomeanalysis多序列分析Clustalmultiplesequencealignment第6页共8页第5页共8页编号：时间：2021年x月x日书山有路勤为径，学海无涯苦作舟页码：第6页共8页.htmlBCMEBIClustalWanalysis系谱分析PAUPEBIClustalWanalysisGCGpackagePHYLIPMEGA/METREEHennig86GAMBIT.../Research/Programs/MacCladePhylogeneticanalysis基因结构预测分析GENSCANGeneFinderGeneFeatureSearchesGrailGrailEXPGeneMarkVeilAAT第7页共8页第6页共8页编号：时间：2021年x月x日书山有路勤为径，学海无涯苦作舟页码：第7页共8页GENEIDGenlangGeneParserGlimmerMZEFProcrustes蛋白质结构预测分析ExpasyPredictingproteinsecondarystructurePredictingprotein3DStructuresPredictingproteinstructures其它分析工具和软件PutativeDNASequencingErrorsCheckMatInspectorFastMWebSignalScanBCMSearchLauncherWebcutterTranslateDNAtoproteinABIMsequencemotifs:第8页共8页第7页共8页编号：时间：2021年x月x日书山有路勤为径，学海无涯苦作舟页码：第8页共8页PfamProDomPRINTS其它多种数据库、分析工具和生物信息学机构多种数据库和分析工具Comparativesequenceanalysis功能基因组分析TranscriptionprofilingtechnologiesProtocolsforcDNAarraytechnologyDatamanagementandanalysisofgeneexpressionarraysExamplesofcommerciallyavailablefilterarrays:GeneFiltersTM(ResearchGenetics)GeneDiscoveryArrays(GenomeSystems)AtlasTMArrays(CLONTECH)
