生态样本制备及DNA提取方法汇总

超实用干货！生态样本制备及DNA提取方法2016-07-15姚美玲 诺禾致源“众里寻她千百度， 蓦然回首，那人却在灯火阑珊处”苦苦追寻的她小编为您找到啦~ 今天小编要带大家共同解密常见生态样本的取样方法以及DNA提取方法， 让你的生态样本制备轻松在握，不再成为你的困惑，赶紧来看看有没有你关注的生态样本类型吧！常见生态样本一览表1. 普通土壤1 ） 取样方法根据研究目的确定采样范围，取样器具要事先消毒灭菌处理。采样时应去除表面浮土，使用乙醇火烧的铲子挖取地下5~20cm的土层，去除可见杂质后，土壤过2mm筛网。每个样品从3 个或以上采样点采集并混合，去除杂质后，每5~10g分为一份，保存于无菌离心管中，置于0 ℃以下运回实验室，用于抽提DNA 。如不能马上实验，置于 -80℃保存。2 ） 提取方法手工提取参考文献：Clegg C D, Ritz K, Griffiths B S. Direct extraction of microbial community DNA fromhumified upland soils [J]. Letters in Applied Microbiology, 1997, 25(1):30-33.推荐试剂盒：MoBioPowerSoil?DNA Isolation Kit 2. 根际土壤1 ）取样方法取样器具要事先消毒灭菌处理，采集20cm深的根际土壤置于50mL的无菌管里，迅速放在液氮里储存，用20目的筛子过筛，去除植物根、动物残骸以及其他杂质后分装到无菌离心管里，每管3~5g，密封后立即放于-80℃储存备用。2 ）提取方法手提方法可参考：[1] Niemi R M, Heiskanen I, Wallenius K, et al .Extraction and purification of DNA in rhizosphere soil samples for PCR-DGGEanalysis of bacterial consortia [J]. Journal of Microbiological Methods, 2001,45(3):155-165[2] Wang J, Wu G, Li W, et al . A DNA extraction method used for evaluation of diversityof the plant rhizosphere microbial community[J]. 2013 推荐试剂盒：MoBio PowerSoil?DNA Isolation Kit 或MoBio PowerSoil High-Throughput DNA Isolation Kit 3. 水体1 ） 取样方法根据研究目的确定采样深度和范围，采集好的水样需要通过滤膜进行过滤，可以根据水样的浑浊程度选择相应孔径的滤膜，之后置于-80℃保存备用。清亮水样： 可选择小孔径的滤膜，一般选0.22 μ m 或 0.45 μ m 的滤膜，过滤水样体积大于 10L ；浑浊水样： 过滤前静置分离悬浮颗粒，也可以用大孔径的滤膜预过...