基于组学数据分析的儿童肾横纹肌样瘤ceRNA网络构建与决策支持

基于组学数据分析的儿童肾横纹肌样瘤 ceRNA 网络构建与决策支持摘 要信息技术的高速发展促进了医疗相关技术的进步，生物医学研究领域也进入了组学时代。人们在不断探索更有效的诊疗方式来保障人类的生命健康。同时，综合运用计算机技术整合大量医学临床数据，通过数据和模型提供更精确的信息帮助或协助医生完成决策的临床决策支持系统也得到了人们的广泛关注。基于此，本文将对儿童肾横纹肌样瘤（malignant rhabdoid tumor of the kindey, MRTK） 展开研究。本文将介绍生物信息学中常见的 ceRNA 网络构建方法，根据在 Genomic Data Commons (GDC）数据库中来自于国家癌症研究所（NCI）的 Therapeutically Applicable Research To Generate Effective Treatments（TARGET）项目下载的转录组数据，采用 R 语言编写程序，利用数据挖掘技术和生物信息学研究方法，开展 MRTK 基因组学信息的数据分析与挖掘实验。在该实验中，我们利用 GDCRNATools 包[1]进行基因差异表达分析并筛选出 16 个 lncRNA、182 个 mRNA 和 64 个 miRNA 参与构建 ceRNA 网络，并对 262个差异表达基因进行生存分析与富集分析，充分挖掘组学数据间的关系，获得对于癌症治疗具有指导意义的靶点或关键通路，探讨其分子机制，找到与 MRTK 生存密切相关的RNA，最终完成对于儿童肾横纹肌样瘤治疗的临床决策支持。关键词：临床决策支持系统；儿童肾横纹肌样瘤；ceRNA 网络；数据挖掘技术PAGE \* MERGEFORMAT2AbstractThe rapid development of information technology has promoted the progress of medical-related technologies, and the field of biomedical research has also entered the era of omics. People are constantly exploring more effective diagnosis and treatment methods to protect human life and health. At the same time, the comprehensive use of computer technology to integrate a large number of medical clinical data, through data and models to provide more accurate information to help or assist doctors to complete the clinical decision support system has also received widespread attention. Based on this, this article will conduct a study on malignant rhabdoid tumor o...