生物信息学复习题一、名词解释生物信息学, 二级数据库, F A STA 序列格式, genbank 序列格式, E n tr ez,BLAST,查询序列(qu e r y),打分矩阵(sc orin g matri x),空位(g ap),空位罚分,E 值, 低复杂度区域,点矩阵(do t m at rix),多序列比对,分子钟,系统发育(ph y l o gen y),进化树得二歧分叉结构,直系同源,旁系同源,外类群,有根树,除权配对算法(UPGMA),邻接法构树,最大简约法构树,最大似然法构树,一致树(consensus t r e e),b o otstrap,开放阅读框(ORF),密码子偏性(c o do n bi as),基因预测得从头分析法,结构域(d omain),超家族,模体(motif),序列表谱(p r o fi le),P AM矩阵,BL O SUM,P S I-BLAST,RefSe q,P DB 数据库,G e nP e pt,折叠子,T r E MB L,MM DB,S C OP,PRO SIT E,G ene Ontolo g y Con so r tium,表谱(pro f i l e)
二、问答题1)生物信息学与计算生物学有什么区别与联系
2)试述生物信息学讨论得基本方法
3)试述生物学与生物信息学得相互关系
4)美国国家生物技术信息中心(N C B I)得主要工作就是什么
请列举 3 个以上 N C BI 维护得数据库
5)序列得相似性与同源性有什么区别与联系
6)BL A S T套件得 blastn、blas t p、blastx、t bla s t n与 tbl a stx子工具得用途什么
7)简述B LAST 搜索得算法
8)什么就是物种得标记序列
9)什么就是多序列比对过程得三个步骤
1 0)简述构建进化树得步骤
11)简述除权