2025年深圳地区杯状病毒感染的分子流行病学特征

2025 年深圳地区杯状病毒感染的分子流行病学特征讨论背景和目的：诺如病毒(Norovirus, NoV)最早是从 1968 年在美国诺瓦克市暴发的一次急性腹泻的患者粪便中分离的病原,并以发现地将其命名为诺瓦克病毒(Norwalk virus, NLVs)。由于该病毒无法进行细胞培育,不能建立动物模型,亦没有敏感的诊断技术,所以在较长时间里(约 20 年),只能用电镜进行小规模的粪便标本检测。最初,这类病毒以电镜下的形态和发现地点命名和分类,随着病毒种类的增多,该种命名和分类的方式很容易引起混乱的缺点日趋明显。目前病毒的分类和命名主要根据病毒形态学、抗原特性、宿主范围和所致疾病的临床症状,特别是病毒基因组序列和结构以及遗传学进化分析的结果进行。经杯状病毒组讨论组(calicivirus study group, CSG)1998 年建议,国际病毒分类委员会(the international committee on taxonomy of viruses, ICTV)批准,将杯状病毒分为四个属,分别是：① Lagovirus:以兔出血病病毒(rabbit hemorrhagic disease virus)为代表：② NoV;③SaV(Sapovirus, SaV);④Vesivirus:以猪水泡疹病毒(swine vesicular exanthema virus)为代表。其中 Lagovirus 和 Vesivirus 感染动物；而 NoV 和 SaV 主要感染人,二者又合称为人类杯状病毒(Human Calicivirus, HuCV)。20 世纪 90 年代初,NoV 病毒的成功克隆和测序分析,大大推动了杯状病毒的讨论,并且分子生物学技术和生物信息学的飞速进展,进一步为 NoV 的深化讨论提供了便利条件,对 NoV 引起急性胃肠炎(acut gastroenteritis, AGE)的危害和意义逐渐得到了充分认识。NoV 作为引起人类 AGE 爆发和散发的重要病原体之一,具有典型季节相关性,在世界各地都有广泛传播,能够感染所有的年龄组人群,极易引起爆发,成为难以控制的胃肠炎疾病,极大影响着人群公共健康。NoV 的共同特征是：直径约为 26-35nm,无包膜,表面粗糙,球形,呈 20 面体对称；可从 AGE 病人的粪便中分离得到,但不能在细胞或组织中培育,也没有合适的动物模型；基因组为无包裹的单股正链 RNA 病毒,RNA 链全长约 7.7kb,包括3 个开放阅读框(open reading frame, ORFs):ORF1 基因全长 5100bp,位于基因组中 5-5104nt 之间,编码一种具有保守序列的多聚酶非结构蛋白,此结构蛋白可裂解为 p48、NTPase、p22、vpg、3c-like protein 和 polymerase6 个小蛋白；ORF2 基因全长 1632bp,位于基因组中 5085～6707nt 之间,编码...