化学生物学复习总结完善版第1章多肽和蛋白质1.蛋白质的定义:蛋白质(protein)是由许多氨基酸(aminoacids)通过肽键(peptidebond)相连形成的高分子含氮化合物2.天然氨基酸的种类和构型:存在自然界中的氨基酸有300余种，但组成人体蛋白质的氨基酸仅有20种，且均属L-氨基酸（甘氨酸除外）3.多肽合成原理:多肽的合成就是形成肽键的过程，即一个氨基酸（AA）氨基亲核进攻另一个氨基酸被活化的羧基部分，形成肽键。氨基酸的活性基团必须进行保护。4.化学合成多肽方法:肽键形成步骤:制备部分保护的氨基酸，形成只有单一活性位点的氨基酸衍生物；将氨基保护的氨基酸羧基部分活化，形成活性中间体，再与自由氨基反应形成酰胺键；脱除氨基酸的保护基。5.固相多肽合成步骤:多肽的C端氨基酸通过linker键连到树脂上；脱除氨基上的临时保护基；与下一个氨基酸缩合；反复进行脱保护和缩合两个步骤；脱除半永久性保护基；6.(EPL)表达蛋白连接及其优点:利用蛋白质剪接技术是通过硫醇解离适当的突变蛋白质--内合太融合体生成重组蛋白硫脂，用于半合成形式的自然化学连接。由于蛋白硫脂通过重组表达得到，因此这种方法称为表白连接。优点：1.大范围蛋白翻译后修饰2.蛋白质中引入数量不限引入非天然氨基酸(应用)2核酸1.DNA复性的定义:在适当条件下，变性DNA的两条互补链可恢复天然的双螺旋构象，这一现象称为复性。增色效应：DNA变性时其溶液OD260增高的现象。核小体的组成:DNA：约200bp组蛋白：H1H2AH2BH3H4核苷酸的组成-------碱基、戊糖、磷酸原核生物细菌)--70S<50S,30S>rRNAs:23S,5S,16S.真核哺乳生物:80S<60S,40S>5SrRNA,28SrRNA,5.8SrRNA,18SrRNAtRNA的二级结构——三叶草形氨基酸臂DHU环反密码环额外环TΨC环。tRNA的三级结构——倒L形。tRNA的功能：活化、搬运氨基酸到核糖体，参与蛋白质的翻译。核酸体外的合成方法（1）核酸的PCR合成技术：一种在体外选择性的将DNA某个特定区域快速扩增的技术。2）核酸的固相合成技术。单体:核苷亚磷酰胺。原理：先将目标核酸链的3’端核苷固定在一个不溶性固相载体上，后沿3’-5’方向依次添加核苷酸至合成所需的长度，再将寡核苷酸链从固相载体上切下，并脱保护基。核酸适体:一类有三维空间结构的单链核酸小分子，与特异靶分子相结合,对靶标分子识别有高度专一性和强亲和力，调节靶标分子的功能。适体的应用:A.荧光修饰的适体用于药物分子的高通量筛选。B.本身可作为药物，适体可作肿瘤生长过程中重要功能蛋白质的直接抑制剂，做抑制癌症的相关靶蛋白。C.用于肿瘤分子成像及肿瘤相关蛋白检测。D用于发现小分子药物。核酶:有催化功能的RNA分子，参与RNA及其前体的加工和成熟过程。肽核酸:一类以中性酰胺键为骨架取代糖磷酸主链的DNA类似物。RNA干扰（RNAi）原理RNA（RNAi）干扰:将与内源性mRNA编码区同源于的双链dsRNA导入细胞，该内源性mRNA发生降解，导致基因表达沉默的现象。作用机制:①dsRNA被内切核酸酶Dicer切割成小片段（21-23bp）siRNA；②RNA聚合酶将siRNA解链③反义siRNA和酶形成RISC沉默复合物④RISC特异识别并切割mRNA⑤断裂mRNA降解糖的化学生物学天然寡糖的构型：寡糖:2-10个糖苷键聚合而成的化合物。糖基连接方式:α-构型、β-构型蛋白聚糖;一条或多条糖胺聚糖以共价键与核心蛋白形成的大分子糖复合物化合物。糖缀合物:单糖、寡糖或多糖与蛋白质和脂质连接形成。包括糖蛋白和糖脂。糖缀合物合成的场所：内质网和高尔基体.寡糖合成方法：寡糖的液相合成:1.线性合成：逐步接长2.收敛式合成先合成小的寡糖片段，以收敛式组装完成合成。3.双向合成4.“一锅法”寡糖的固相合成:端基羟基连接到树脂上酶促寡糖合成:1糖基转移酶2）糖苷酶3）糖基合成酶1.糖的保护基满足的条件：便宜、稳定、无毒，引入条件适合；反应过程中稳定；脱除高效且条件条件温和；脱除后，易与产物分离。保护基的正交性;同时存在多种保护基时，脱除一种不对其他产生影响。糖生物学主要研究内容:糖作为信息分子和调分子在生物体的各项生命活动及病理机制中的作用。糖序列分析方法:酶法分析N-连接寡糖结构；采用凝集素分离、分析寡糖和糖缀合物；质谱MS和核磁共振NMR测定结构。有...
