生物进化树的构建 目 录 前言........................................................................................................................................................... 2 一、 NCBI ................................................................................................................................................. 6 二、 Mega ................................................................................................................................................. 9 三、 DNAMAN....................................................................................................................................... 15 四、DNAStar ......................................................................................................................................... 18 五、 Bio edit ............................................................................................................................................ 21 前言 1．背景资料 进化树(ev olu tionary tree)又名系统树(phy logenetie tree)进化树，用来表示物种间亲缘关系远近的树状结构图。在进化树中，各个分类单元（物种）依据进化关系的远近，被安放在树状图表上的不同位置。所以，进化树简单地表示生物的进化历程和亲缘关系。已发展成为多学科(包括生命科学中的进化论、遗传学、分类学、分子生物学、生物化学、生物物理学和生态学,又包括数学中的概率统计、图论、计算机科学和群论)交叉形成的一个边缘领域。 归纳总结生物进化的总趋势有以下几类： ① 结构上：由简单到复杂 ② 生活环境上：由水生到陆生 ③ 进化水平上：由低等到高等 一般来说，进化树是一个二叉树。它由很多的分支和节点构成。根据位置的不同，进化树的节点分为外部节点和内部节点，外部节点就是我们要进行分类的分类单元（物种）。而物种之间的进化关系则用节点之间的连线表示。内部节点表示进化事件发生的地方，或表示分类单元进化的祖先。在同一个进化树中，分类单元的选择应当标准一致。进化树上不同节点之间的连线称为分支，其中有一端与叶子节点相连的分支称为外枝，不与叶子节点相连的分支称为内枝。 进化树一般有两种：有根树和无根树。有根树有一...
