高通量测序文库构建基因文库是什么经典定义:将含有某种生物不同基因的许多DNA片段,导入受体菌的群体中储存,各个受体菌分别含有这种生物的不同的基因,称为基因文库
基因文库一基因文库包括DNA文库,RNA文库和质粒文库
海量基因间隔序列基因难直接分离调控序列非编码序列重复序列为什么要构建基因文库单个基因表达量低其他文库DNA文库RNA文库基因文库类型二双末端测序文库单末端测序文库DNA大片段文库序列靶向捕获文库单细胞基因组测序文库二2
1DNA文库DNA-seq实验流程图MALBAC法普通RNA文库构建1链特异RNA文库构建2小RNA文库构建3单细胞RNA组测序文库构建45RNA2
2RNA文库降解组测序文库构建首先,我们获得细胞总RNA,然后根据实验需要,比如是需要测mRNA,ncRNA还是smallRNA等,对RNA样品进行处理
处理好的RNA再进行片段化,然后反转录形成cDNA,获得cDNA文库,然后在cDNA片段的两端接上接头,最后用新一代高通量测序依进行测序
RNA-seq实验流程图链特异性RNA文库主要用于lncRNA测序,circRNA测序SmallRNA是一类长度在20-30nt重要的体内调节分子,主要包括miRNA、piRNA和siRNA
SmallRNA测序技术采用胶分离技术,收集样品中18-30nt或18-40nt的RNA片段,利用高通量测序技术,一次性获得单碱基分辨率的数百万条小RNA序列信息
靶向三序列捕获测序序列捕获测序,是将感兴趣的基因组区域定制成特异性探针与基因组DNA进行杂交(固相或液相),将目标基因组区域的DNA片段进行富集后再利用第二代测序技术进行测序
主要有外显子捕获和特定基因区捕获
主要用于孟德尔疾病,肿瘤,个体化用药和复杂疾病安捷伦芯片片段大小:150-200bp测序平台:IlluminaHiSeq、MiSeq实验周期:2天Nimbl