重要作物中 PAL 基因家族的鉴定和序列分析 作者:盖江涛 沈建凯 王鹏来源:《江苏农业科学》第 06 期 摘要:苯丙氨酸解氨酶(PAL,phenylalanine ammonia-lyase [EC:4
24])存在于多个植物和部分微生物中,是与植物抗病性有关的核心酶,含有重要的植物生理意义
采用BLASTP 的办法,依靠全基因组数据库,获得了拟南芥[Arabidopsis thaliana (L
) Heynh
]、水稻(Oryza sativa L
)、玉米(Zea mays Linn
)、小麦(Triticum aestivum Linn
)、谷子[Setaria italica (L
]、大豆[Glycine max (Linn
) Merr
]6 种植物中的 PAL 基因家族共 45 条序列,对其进行了系统进化分析、生物信息学分析等
分析成果显示:单子叶植物与双子叶植物分别聚集在不同的分支,阐明单子叶植物水稻、玉米、小麦、谷子亲缘关系较近,双子叶植物拟南芥、大豆亲缘关系较近,而单子叶植物与双子叶植物亲缘关系较远,也阐明PAL 基因的分化在单子叶植物和双子叶植物分化前形成;酸性蛋白质占 93
3%,稳定性蛋白占97
8%,有信号肽的蛋白占 2
2%,有导肽的蛋白占 4
4%,全部蛋白均为有明显跨膜现象的亲水性蛋白;全部 PAL 基因亚细胞定位于细胞质中,都有蛋白活性位点
分析成果为进一步研究作物中 PAL 代谢机理提供理论支持
核心词:苯丙氨酸解氨酶;PAL;基因家族;氨基酸 中图分类号: Q78 文献标志码: A 文章编号:1002-1302()06-0045-05 苯丙氨酸解氨酶(phenylalanine ammonia-lyase,PAL,EC:4
24)存在于多个植物和少数微生物中,是现在研究较多的与植物抗病