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MassARRAY 图〔1〕 MassARRAY 系统由美国Sequenom 公司开发,在癌症研究、遗传学分析、分子诊断和药学等领域已经得到越来越广泛的应用,受到全球多个顶尖研究中心的推崇。 应用领域 飞行时间质谱技术搭配不同 Sequenom 的检测和软件模块,可以在一个平台上实现以下技术: SNP 分型以及 SNP 位点等位基因频率计算 体细胞突变检测和分析 甲基化定量分析 基因表达定量分析 CNV 检测分析 寡核苷酸质量控制和检测 检测服务流程 客户提供 DNA 或者各类生物样本以及检测位点信息 样本完整性检测以及前处理 引物设计、合成 PCR 扩增、SAP 纯化、延伸或转录裂解 点样 质谱分析 分析报告 SNP分型 1、技术名称 Sequenom MassARRAY SNP 基因型分析技术 MassARRAY 技术流程: 2、技术原理 Sequenom SNP 检测系统基本原理为基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 (MALDI-TOF MS) 技术。主要特点是,PCR 扩增后的产物,加入 SNP 序列特异延伸引物,在 SNP 位点上,延伸 1 个碱基。然后将制备的样品分析物与芯片基质共结晶,将该晶体放入质谱仪的真空管 , 而后用瞬时纳秒 (10-9s) 强激光激发,由于基质分子经辐射所吸收的能量,导致能量蓄积并迅速产热,从而使基质晶体升华,核酸分子就会解吸附并转变为亚稳态离子,产生的离子多为单电荷离子,这些单电荷离子在加速电场中获得相同的动能,进而在一非电场漂移区内按照其质荷比率加以分离,在真空小管中飞行到达检测器。MALDI 产生的离子常用飞行时间(Time-of-Flight,TOF )检测器来检测,离子质量越小,就越快到达。理论上讲,只要飞行管长度足够,TOF 检测器可检测分子的质量数是没有上限的。MASSARRAY SNP 检测的质谱范围为5000 到 8500 Dalton。 图 2:飞行时间质谱法对 SNP进行分型的原理示意图 质谱检测 3、 技术特点 灵活: ¨ 可以自由选择感兴趣的 SNP 位点 ¨ 一张芯片上,样本的数量和位置可以自由选择 ¨ 一张芯片上,样本和 SNP 位点的配对可以自由选择 准确: ¨ 直接检测待测物分子量,准确度超过 99.7% ¨ 质谱技术灵活检测PCR 实验失败或三等位基因的存在 高通量: ¨ 一张芯片上可完成 384 个样品的多重 iPLEX GOLD 实验 ¨ 每个反应孔可实现多达 40 重反应 ¨ 每天最多能进行十万个基因型分析 性价比高: ¨ 无需荧光标记,成本大大降低 ¨ 即便在低通量的情况下每个基因型分析的成本...

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