第二章数量遗传学基础重复力VIP免费

第二章数量遗传学基础第三节数量性状遗传参数分析数量性状遗传研究的基本统计方法*总体(poputlation)和样本(sample)*总体参数(parameter)与样本统计量(statistic)资料均值资料变异程度资料相关程度资料变异程度用以衡量群体数量资料的变异程度(也称离中性/分散程度)的参数主要有：–方差/均方(variance,V/S2)；–标准差(standarddeviation,S)。总体资料的参数由样本的统计量估计：–方差的计算公式；–标准差的计算公式。当样本容量大于30时，可用n代替n-1计算方差与标准差。*资料相关程度用以衡量同一遗传群体不同数量性状间相互关联程度的参数主要是：–协方差(covariance,C)；–相关系数(correlationcoefficient,r)。总体协方差与相关系数也由样本统计量估计：–样本协方差的估计；–样本相关系数的估计。遗传参数参数（parameter）–反映总体特征的数遗传参数(geneticparameter)–反映总体遗传特征的参数,即指为了进行基因型选择而估计育种值时所必须参考的一些常数。–数量性状的三个最重要的遗传参数：重复力，遗传力，遗传相关–不可观测，只能用统计学方法进行估计一、重复力1.重复力（repeatability）的定义：-同一个体某一性状各次度量之间的相关（可重复的程度）,用统计学语言表达，是指同一个体不同次生产记录的组内相关系数（intraclasscorrelation）。•在时间上的重复：产奶量、产仔数•在空间上的重复：羊毛品质)()()()()(22222wbbTber组内方差组间方差组间方差总方差组间方差2.影响同一个体同一性状各次度量之间相关性的因素：–遗传：各次度量值受相同的遗传因素（基因型）影响–环境：持久性环境效应组间方差=遗传方差+持久环境方差一、重复力3.重复力的估计个体度量值（表型值）合计111x12x11nxjx1221x22x22nxjx2k1kx1kxkknxkjx①模型：ijiijebx个体（组）效应（随机）随机误差一、重复力②方差分析变异来源自由度平方和均方期望均方组间k–1SSBMSB202BWn组内N-kSSWMSW2W总变异N-1SSTinNNnNkni2011一、重复力3.重复力的估计一、重复力221ijijijijTxNxSS221)(1ijijijijiBxNxnSSBTWSSSSSSWWMS2ˆ02ˆnMSMSWBBWBWBWBBeMSnMSMSMSr)1(ˆˆˆˆ02223.重复力的估计4.重复力的主要用途一、重复力①确定n次度量的相对精确性：ijiijebx•一次度量：222ebx•n次度量平均数：iiiebxnrnnrrnexxexeebebx)1(1)1(2222222222222xbebber22xexrn4.重复力的主要用途eexxrnnr)1(111•n次度量的相对精确性：②作为遗传力估计值的上限erHh220③用于育种值估计4.重复力的主要用途不同度量次数的相对精确性0.30.40.50.60.70.80.9112345678910111213度量次数（n）相对精确性re=0.5re=0.75re=0.25re=0.14.重复力的主要用途④估计个体终生平均生产能力-根据个体的前n次记录的平均数估计其终生平均生产能力•n次度量平均数的重复力eexxexbnernnrrr)1(12222)(•个体终生平均生产能力估计值xrPrPxrPPnenene)()()()1()(群体平均数二、遗传力（一）遗传力（heritability）的定义–遗传变异占总变异(表型变异)的比率，用以度量遗传因素与环境因素对性状形成的影响程度，是对杂种后代性状进行选择的重要指标。P=G+E=A+D+I+Es+Er=A+RRAEIDAEGPVVVVVVVVV（一）遗传力（heritability）的定义①广义遗传力(heritabilityinthebroadsense):遗传方差占总方差(表型方差)的比率GPPGdVVH2PrGEGEH②狭义遗传力（heritabilityinthenarrowsense）:加性方差占总方差的比率。APPAdVVh2PrGEARh二、遗传力遗传力=0.25（一）遗传力（heritability）的定义期望的后代平均性能亲本的性能（与群体均数的离差）h2=0.5h2=0.25h2=0.10（一）遗传力（heritability）的定义（二）遗传力的估计1.基本原理①根据亲属之间的相关...