精品文档---下载后可任意编辑F-box 基因拷贝数目变异的机制讨论——以 12 种果蝇为例的开题报告摘要:F-box 基因家族在真核生物中广泛存在,涉及到许多细胞生物学过程的调节。由于在遗传意义上的类似性和相似的结构域,F-box 基因拷贝数目变异被认为是一种重要的基因家族演化方式。因此,本讨论以 12种果蝇为对象,探究了 F-box 基因的拷贝数目变异机制。本讨论采纳以下几个方法:1)使用生物信息学方法对 12 个果蝇基因组数据进行筛选,猎取 F-box 基因序列;2)对所猎取的基因序列进行比对和聚类分析,依据相似性进行 F-box 基因的分类;3)将各个果蝇物种的 F-box 基因进行系统发育分析,并结合分子钟模型推算 F-box 基因拷贝数目变异时间。估计结果表明,12 种果蝇的 F-box 基因存在明显的拷贝数目变异。其中,在演化时间中较为短的果蝇物种(如 D. erecta)的 F-box 基因拷贝数目比较稳定。而在演化时间较长的物种(如 D. melanogaster),F-box 基因的拷贝数目变异程度较高。此外,相似性比较和聚类分析将 F-box 基因分为数百个亚族,不同亚族的演化速度和拷贝数目变异程度也有所不同,可能受到基因互作和遗传变异因素的影响。综上,本讨论将有助于揭示 F-box 基因家族演化的机制,有益于更好地认识真核生物基因家族的演化模式和进化过程。