diamond--教程系列

第一章 Diamond3 界面选项的功能介绍在本章中我们首先介绍一下一个典型的 diamond3 界面上所有选项的基本功能。一个典型的 diamond3 的界面打开 C:\ProgramFiles\Diamond3\Tutorial\文件夹中的 pyrene.cif 文件（上图所示）。floiypE：!■.*■£tiTtorlal.Q□#Dialled-[…9dlsacmd3...CH険电 J—虹 15=14第一节 File 菜单系列1.1File 菜单简介File 菜单系列，包括 Windows 系统常规的几种选项（如图 2 所示。帚匚［pyrtftfc〕匚］隨|遍闌 ］ 註踰 gruciirp 跌址却呼 僅槪箱 l«te 堆匚站 " P■冷濡网叱 gn...CirM■如Q83 桶花国#-00♦W-SMluAiVe图 1.2File 菜单系列1.2 常用选项1.2.1Open 选项点击该选项，可以看到 diamond3 可以打开的所有文件类型（如图 3 所示）。图 1.3Diamond3 支持的阅读格式丹出 anewEtrLKtue 匸如«tTLndevi...T!■rutari&L.pd...*D3.5R?rri-匚・专曲汕 aM.3...CM前三项是该公司开发的 Diamond 及 Endeavour 软件的默认格式。其中 Cif 文件格式最为通用。ICSD/Crystin 及 CSD-FDat 是两个晶体学数据库输出的文件格式。ProteinDataBank 格式表示支持蛋白质晶体数据库文件。常用的格式还包括笛卡儿 xyz 座标格式，这在构建特殊结构模型时极为便利，比如我们会在后面章节中提到的螺旋体的构建。1.2.2 Save 选项这里默认的保存格式是 Diamond3Document(*.diamdoc)格式。1.2.3 Saveas 选项共包括三个次级选项：图 1.4Diamond3Saveas 的三个次级选项在实际应用中，前两项功能相似，我们以 SaveDocumentAs 为例进行介绍:SaveDocumentAs 提供 14 种文件格式：图 1.5Diamond3 支持的 14 结构储存格式Stfrtd■亡 acbrt：documesTtane#r-Btrtlil 血扩疔叵滲 13+JC