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DNA计算中荧光技术的应用及其发展

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DNA 计算中荧光技术的应用及其开展张成 杨静 王淑栋 (北京大学信息科学技术学院,高可信度软件技术教育部重点实验室,北京 100871)摘要:DNA 计算作为前沿科学讨论的重点和热点,已经从简单开展为复杂,从理论转化为应用。在这一过程中,反响速度快,变化灵敏的荧光标记技术发挥了重要的作用。本文围绕 DNA 计算和荧光标记技术两个方面进行说明。一方面,对近年来 DNA 计算中荧光技术的应用进行了总结:〔1〕荧光标记的外表计算。〔2〕与某些酶切技术相结合的荧光检测。〔3〕与 DNA 链置换相结合的荧光技术。〔4〕与基因沉默技术相结合的荧光 DNA 逻辑门。〔5〕与 DNA 自组装立体结构相结合的荧光技术。〔6〕与 DNA 变构相结合的荧光技术。另一方面,介绍了几种近年来开展起来的新型荧光技术:〔1〕荧光信号识别放大技术。〔2〕与磁珠技术相结合的荧光技术。〔3〕与 PH 值变化相结合的 DNA 荧光技术。〔4〕与 miRNAs 检测相结合的荧光技术。在今后的讨论中,只有将这两者紧密结合,才能发挥DNA 计算天然的优势。关键词:DNA 计算;荧光标记技术;纳米技术;DNA 分子;杂交 1 引言DNA 由于其具有的特性,在大自然的进化中,被选择为稳定的遗传物质。在细胞中 ,DNA 精细地编码并控制着整个细胞的新陈代谢。另一方面,DNA 分子容易构成二级甚至三级结构。因此,DNA 作为计算工具有着得天独厚的优势 1,2。近年来,DNA 计算领域开展迅速,尤其在 DNA 分子自组装、DNA 纳米装置等方面 3。然而伴随着 DNA 计算解决问题的规模增大和形式多样化,求解过程中 DNA 分子数量急剧增加以及 DNA 分子结构复杂性的加大,求解过程中实验过程繁琐且存在误差,使得 DNA 计算中解的标记和检测变得更加困难 4。为了解决这一难题,荧光技术在 DNA 计算中逐渐得到了广泛的应用。荧光是指某些物质受到某种波长的光激发后,其原子中的电子被激发到较高能级,产生的发射光荧光物质分子都具有刚性结构和共平面的 π-π 共轭体系。在激发态时,这种结构具有稳定性,可以持续数秒钟,从而有利于能量的转移 5。DNA 荧光技术在生物学领域中已经有很多应用,如近年来开展起来的 DNA 荧光标记、real-time 检测技术、分子信标技术等。荧光标记 DNA 简单便捷,可以实时检测,而且灵敏度非常高,这些特点都使得其在 DNA 计算中具有广泛的应用前景。目前,结合荧光技术的 DNA 计算已经成为前沿讨论热点。荧光技术在 D...

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