蛋白质功能预测方法概述摘要: 蛋白质是生物体内最必需也是最通用的大分子，对它们功能的认识对于科学领域和农业领域的进展有着至关重要的作用。随着后基因组时代的进展，NCBI 数据库中迅速涌现出大量不明结构与功能的蛋白质序列，这些蛋白质序列甚至一跃成了讨论的热点。近几十年来蛋白质功能预测的方法不断被完善。由最初的仅基于蛋白质序列或3D 结构信息的方法衍生出更多的基于序列相似性、基于结构基序、基于相互作用网络等新方法，这些新型方法采纳新的算法、新的讨论思路和技术手段，力求得到准确性与普遍性并存，能够被广泛应用的蛋白质功能预测方法。本文综述了近年来蛋白质功能预测的方法，并将这些讨论方法分类归纳，各自阐明了每类方法的优缺点。关键词: 蛋白质功能预测方法，结构基序，相互作用网络，ESGAn Overview protein function prediction methodsAbstract: Protein is the most necessary and versatile macromolecules in vivo，researches on their functions are veryimportant to the fields of science and the development of the agriculture． With the development of the post － genomicera，the NCBI database quickly emerges a large number of protein sequences of unknown structure and functions，which even become hot research Points． In the recent decades，protein function prediction methods have beenmore and more improved and developed． This article reviews the protein function prediction methods occured in recentyears，All these methods were inducted and classicicated，and their advantages and disadvantages of each methodswere illustrates respectively．Keywords: Protein Function Prediction Methods，Structal Motif， Interaction Networks，ESG1 引言基因组学和蛋白质组学在过去十年的进展过程中产生了大规模的新的蛋白质序列和试验数据，科学家为了确定这些新序列的功能借助计算机手段进行了大量的讨论［1 － 2］。在过去的二十年里，人们利用计算机技术对蛋白质功能进行预测的文章发表了上千篇之多( http: / /www． ncbi． nlm． nih． gov /pubmed) ，大部分是基于序列相似性、基于结构域、基于相互作用网络等方法预测，再利用...
