第1页共18页编号:时间:2021年x月x日书山有路勤为径,学海无涯苦作舟页码:第1页共18页第一章蛋白质的结构和功能构型:指在立体异构体中取代原子或基团在空间的取向
构型的改变涉及共价键的破裂和重建
构象(conformation):指构成分子的原子和基团因为化学键的旋转而形成在三维空间上不同的排布、走向
构象的改变不涉及共价键的破裂,仅涉及氢键、疏水键等次级键的变化一级结构:指多肽链中氨基酸的排列顺序
稳定因素:肽键二级结构:多肽链的某一段肽链中,邻近氨基酸残基之间,通过氢键形成的有规则重复的(α-螺旋和β-折叠)、部分有规则的(β-转角和Ω环)或无序结构的一种局部构象
二面角(构象角)连结两个相邻肽平面的Cα产生的角
二面角决定了两个相邻肽平面的空间相对位置
二级结构与一级结构的关系:各种氨基酸残基在不同的二级结构中出现的频率不同a
形成α-螺旋能力强的氨基酸有:Glu、Met、Ala、Leub
形成β-折叠能力强的氨基酸有:Val、Ile、Tyrc
形成β-转角能力强的氨基酸有:Pro、Gly、Asn、Asp、Ser;此外,多肽链中若存在连续酸性或碱性的氨基酸残基时,因同电相斥也影响构象的形成,所以,多肽链的R侧链的位置、大小、极性、荷电情况等,最终决定蛋白质二级结构的形成
超二级结构:相邻的几个二级结构相互作用形成有规则的组合体,是特殊的序列或结构的基本组成单元,又称为基序或模体
αα(EFhand;Leucinezipper)ββ、βαβ
结构域:超二级结构进一步组合折叠成半独立紧密的球状类型:1,平行α/β型2,反平行β-型3,全α-型4,小的不规则结构三级结构:在二级结构,超二级结构及结构域基础上,一级结构相隔较远的氨基酸残基以次级键相连,盘旋折叠成球状,形成包括主链和侧链在内所有原子和基团的特定空间排布稳定因素:侧链R基团之间相互作用形成的各种非共价键,包