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三种新冠病毒核酸提取方法的效果评价VIP免费

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三种新冠病毒核酸提取方法的效果评价【摘要】目的通过比较三种核酸提取方法,了解不同新冠病毒核酸提取方法的性能。方法采用核酸释放剂法、磁珠法和离心吸附柱法对10份浓度为500copies/ml的新冠病毒阳性质控品和58例新冠病毒核酸检测双阳性的鼻咽拭子样本进行核酸提取,提取后的核酸在同一品牌的荧光定量PCR扩增仪上,使用同一品牌的新冠病毒核酸扩增试剂进行RT-PCR扩增,对三种新冠病毒核酸提取方法的效果进行比较。结果试验结果显示,离心吸附柱法核酸提取效率最高,磁珠法次之,核酸释放剂法最低。结论离心吸附柱法提取核酸的效果最好,但操作繁琐、耗时,适合对阳性结果的复核。其次是磁珠法,既可以满足临床要求,又可以实现自动提取,适合于大样本的检测。核酸释放法虽然节省了核酸提取步骤和操作时间,但在三种方法中核酸提取的效率最低。关键词:新型冠状病毒;核酸提取;实时荧光定量PCREvaluationofthreemethodsforextractingCOVID-19nucleicacidLIANGQihe,LIANGWanzhen,LIUJianting(ClinicallaboratoryofJiangmenCentralHospital,Jiangmen529070,China)[abstract]ObjectivetoinvestigatetheperformanceofdifferentCOVID-19nucleicacidextractionmethodsbycomparingthreenucleicacidsextractionmethods.Methodsnucleicacidsfrom10positiveCOVID-19QCsampleswith500copies/mlconcentrationand58positivecoronavirusnasopharyngealswabsampleswereextractedbynucleicreleaser,magneticbeadmethodandspincolumnmethod.TheextractednucleicacidswereamplifiedbyRT-PCRusingthesameCOVID-19nucleicacidamplificationreagentonthesamefluorescentquantitativePCRanalyzer,TheeffectsofthreeCOVID-19nucleicacidextractionmethodswerecompared.ResultsThetestresultsshowedthatthespincolumnmethodhadthehighestextractionefficiency,followedbymagneticbeadmethod,andtheextractionefficiencyofnucleicreleaserwasthelowest.ConclusionThespincolumnmethodhasthebestperformancefornucleicacidextraction,butitistediousandtime-consumingandsuitableforthereexaminationofpositivepatients.Thesecondisthemagneticbeadmethod,whichcanbothmeettheclinicalrequirementsandrealizeautomaticextraction,suitableforthedetectionoflargesamples.Nucleicreleaseralthoughsavingnucleicacidextractionstepsandoperatingtime,theefficiencyofnucleicacidextractionwasthelowestamongthethreemethods.[Keywords]2019novelCoronavirus;nucleicacidextraction;Real-timefluorescencequantitativePCR2019年12月以来,在中国武汉爆发、流行的肺炎被中国科学家发现,该致病菌可以引起新型冠状病毒肺炎。2020年2月国际病毒分类委员会的冠状病毒研究小组将该病毒命名为SARS-CoV-2(severeacuterespiratorysyndromecoronavirus2),世界卫生组织将新冠病毒引起的疾病命名为COVID-19(CoronaVirusDisease2019。目前检测新冠病毒的方法主要是抗体和病毒核酸检测,病毒核酸检测为金标准,抗体还是辅助诊断手段[3-5][2][1]。新冠病毒检测的主要步骤为核酸提取、RT-PCR扩增。核酸提取的质量成为核酸检测质量的前提和保障,目前核酸提取的方法有磁珠提取、柱提取和核酸释放方法,由于提取核酸方法的原理、步骤、影响因素等导致核酸提取的效率也不同,本文拟通过对三种不同的核酸提取方法进行比较分析,综合评价不同的核酸提取方法对核酸检测结果的影响,为医院实验室等核酸检测机构选择适宜的核酸提取方法提供参考依据。1材料与方法1.1试剂与设备核酸释放剂法、磁珠法和离心吸附柱法核酸提取试剂均为市场上公开销售的产品,新冠病毒核酸扩增试剂购自中山大学达安基因股份有限公司,2019新型冠状病毒核糖核酸液体质控品购自广州邦德盛生物科技有限公司,西安天隆科技有限公司GeneRotex全自动核酸提取仪,美国应用生物系统公司7500荧光定量PCR分析仪。1.2样本来源样本来自本院境外输入的新冠病毒核酸检测双阳性的住院病人16例,其中男11人,女5人,年龄在26-45岁,住院隔离期间共收集鼻咽拭子样...

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