R环的形成及对基因组稳定性的影响VIP免费

Hereditas(Beijing)2014年12月,36(12):1185―1194www.chinagene.cn综述收稿日期:2014−04−01;修回日期:2014−06−05基金项目:北京理工大学自然科学基础基金项目(编号：3160012211215)和北京市自然科学基金项目(编号：5132014)资助作者简介:潘学峰，博士，教授，研究方向：分子遗传学。E-mail:xuefengpancam@aliyun.comDOI:10.3724/SP.J.1005.2014.1185网络出版时间:2014-10-1616:06:06URL:http://www.cnki.net/kcms/detail/11.1913.R.20141016.1606.005.htmlR环的形成及对基因组稳定性的影响潘学峰1,2，姜楠1，陈细芳1，周晓宏1，丁良2，段斐21.北京理工大学生命学院，北京100081；2.河北大学基础医学院，保定071002摘要:R-环是由一个RNA:DNA杂交体和一条单链状态的DNA分子共同组成的三链核酸结构。其中，RNA:DNA杂交体的形成起因于基因转录所合成的RNA分子不能与模板分开，或RNA分子重新与一段双链DNA分子中的一条链杂交。在基因转录过程中，当转录泡遇到富含G碱基的非模板链区或位于某些与人类疾病有关的三核苷酸卫星DNA时，转录泡后方累积的负超螺旋可促进R环形成。同时，新生RNA分子未被及时加工、成熟或未被快速转运到细胞质等因素也会催生R环。研究表明，细胞拥有多种管理R环的方法，可以有效地管理R环的形成和处理已经形成的R环，以尽量避免R环对DNA复制、基因突变和同源重组产生不利影响。文章重点分析了R-环的形成机制及R环对DNA复制、基因突变和同源重组的影响，并针对R-环诱导的DNA复制在某些三核苷酸重复扩增有关的神经肌肉退行性疾病发生过程中的作用进行了分析和讨论。关键词:RNA:DNA杂交体；R-环；基因转录；DNA复制；基因组稳定性R-loopstructure:theformationandtheeffectsongenomicstabilityXuefengPan1,2,NanJiang1,XifangChen1,XiaohongZhou1,LiangDing2,FeiDuan21.SchoolofLifeScience,BeijingInstituteofTechnology,Beijing100081,China;2.SchoolofBasicMedicine,HebeiUniversity,Baoding071002,ChinaAbstract:R-loopisatypeofthree-strandednucleicacidstructurethatismadeupofanRNA:DNAhybrid,formedduetofailingseparationofanascentRNAmoleculewithtranscriptingtemplateintranscriptionorbythere-annealingofRNAmoleculewithoneofthetwostrandsinadoublestrandedDNAmolecule,alongwiththesinglestrandedDNA,whichiseitherthenon-templatestrandinthetranscriptionbubbleortheRNAsubstitutedDNAstrand.FormationofR-loopscanoccurwhentranscriptiongoesthroughagenomicDNAregionhavingatractofGbasesinthenon-templatestrandinthetranscriptionbubbleorthroughatypeoftripletmicrosatelliteDNAsequencesthatareknowntobeassociatedwithcertainhumandiseases.Thenegativesupercoilingforcesaccumulatedinthetranscrip-tionbubble,andthemisprocessingofRNAprecursors,aswellasthedelayedutilizationsandtransportationsofRNAmoleculestocytoplasmpromoteRloopformation.ManystudiesshowthatcellscanmanageRloopformationwithefficiency,andcanalsoprocesstheR-loopsalreadyformedinthecell,andbywhich,thebadeffectsofR-loopsonDNAreplication,genemutationandhomologousrecombinationcanberegulated.Inthisreview,wesummarizethe1186Hereditas(Beijing)2014第36卷formationandtheimpactsofR-loopsonDNAreplication,mutationratesandthefrequenciesofhomologousrecom-bination,andalsodiscussethepossibleroleoftheR-loopinducedDNAreplicationinmediatingtrinucleotiderepeatexpansionsasseenwiththosefrequentlyassociatedwithhumanneuromusculardegenerativediseases.Keywords:RNA:DNAhybrid;R-loop;genetranscription;DNAreplication;genomestabilityDNA复制是DNA聚合酶依半保留方式合成双链DNA的过程，而基因转录则是RNA聚合酶利用双链DNA中的一条链为模板合成RNA的过程。基因转录产生的RNA分子必须在转录泡后方与DNA模板分开，以容许两条被打开呈单链的DNA分分重新恢复为双链DNA。但是，发生在某些基因组位点处的基因转录所合成的RNA分子难于与其...