基因组的种类与结构特点•其他病毒基因组(virusgenome)质粒DNA(plasmidDNA)又称染色体外DNA(extrachromosomalDNA)(2)大小•基因组大小(genomesize)一般以单倍体基因组的核酸量来衡量,单位有pg(10-12g)、Dalton(道尔顿)、bp或kb、Mb等•1pg=6.02x1011Daltons=9.8x108bp生物的复杂程度与基因组大小的关系各类生物中基因组大小的变化范围生物种类基因组大小范围(kb)最大/最小真细菌革兰氏阴性菌革兰氏阳性菌蓝细菌枝原体古细菌原生生物眼虫(裸藻)纤毛虫变形虫真菌650~13,200650~7,8001,600~11,6003,100~13,200650~1,8001,600~4,10023,500~686,000,00098,000~2,350,00023,500~8,620,00035,300~686,000,0008,800~1,470,0002012743329,1912436719,433167各类生物中基因组大小的变化范围生物种类基因组大小范围(kb)最大/最小动物海绵动物环节动物软体动物甲壳动物昆虫棘皮动物鱼类两栖动物爬行动物鸟类哺乳动物植物藻类蕨类植物裸子植物被子植物49,000~139,000,00049,000~53,900882,000~5,190,000421,000~5,290,000686,000~22,100,00098,000~7,350,000529,000~3,230,000382,000~139,000,000931,000~84,300,0001,230,000~5,340,0001,670,000~2,250,0001,420,000~5,680,00050,000~307,000,00080,000~30,000,00098,000~307,000,0004,120,000~76,900,00050,000~125,000,0002,837161332756364914146,1403753,133172,500C值佯谬(C-ValueParadox)•基因组中基因数目与基因组大小无关•生物体单倍体基因组所含DNA总量称为C值EukaryotesGenomesize:80,000foldsGenecontent:40~50folds(3)类核基因组和核基因组的结构特点•类核基因组环状;基因排列紧密,较少非编码序列:“streamlined”•核基因组多线状;大小变化范围很大;有大量的非编码序列(重复序列、内含子等)(4)非编码序列(non-codingsequences)•非编码的重复序列(核基因组)(a)局部分布的重复序列(localizedrepeatedsequences)串联式(tandem)的高度重复序列(highlyrepeatedsequences)(b)散布的重复序列(dispersedrepeatedsequences)短的散布式重复序列(shortinterspersedelements,SINEs)长的散布式重复序列(longinterspersedelements,LINEs)•内含子(intron)I类(groupIintron)II类(groupIIintron)III类(groupIIIintron)核mRNA内含子(nuclearmRNAintron),即剪接体内含子(spliceosomalintron)核tRNA内含子(nucleartRNAintron)古细菌内含子(archaebacterialintron)(5)细胞器基因组•线粒体基因组在不同类型的生物(多细胞动物、高等植物、原生动物、藻类、真菌)中变化很大多细胞动物:细小、致密高等植物:复杂、不均一原生动物、藻类、真菌:或偏向于动物型,或偏向于植物型,但又有其各自的独特之处(5)细胞器基因组•叶绿体基因组比较均一,85~292kb特例:伞藻属(Acetabularia),2000kb