1 一、SPM 的安装与启动 先安装 matlab，然后将 SPM 复制到 matlab 下的一个文件夹（SPM2 需要 matlab6.0 或以上版本）。启动 matlab，首先 set path，然后在 matlab 命令窗口中输入 SPM 即可启动，然后选择 fMRI，也可以直接输入 SPM fMRI 二、SPM 数据处理概要 先将所得数据进行空间预处理（对齐，平滑，标准化等），然后进行模型估计（将刺激的时间、间隔与血流动力函数进行卷积，所得结果与全脑象素信号进行相关分析），最后察看结果。 三、SPM8 数据处理的一般步骤 为方便后续的数据处理，如果数据分散处理后整合，建议所有处理数据路径保持一致，要统一路径。处理前首先要采用数据转换软件将 dicom 数据转换成 SPM 解析格式，然后进行数据预处理，预处理结束后到 matlab 安装目录中备份 spm*.ps 文件，其中包含了空间校正和标准化的信息，然后进行建模分析。 运行命令：spm fmri，打开 spm8 的操作界面 我们称左上侧的窗口为按钮窗口(button w indow )，左下侧的窗口为输入窗口(input w indow )，右侧大窗口为树形结构窗口或图形窗口(Tree Building Window or the graphics w indow )。 在 spm8 和 spm5 中，每一步处理都采用了直观的“树形结构”的面板，如果一个分支项左面有“+”号，你可以双击显示子分支项， 如果一个分支项右面有“<-X”号，你必须为之指定选项(否则不能运行该 tree)，分支项的选项在其右侧面板指定，而帮助信息则在下面的面板中显示。如果我们处理数据没2 有特殊需求，我们只关心带有“<-X”项目并完成输入即可，其余均可采用默认设置。另外注意在Tree Building Window 的顶部菜单，新增了一个菜单项“TASKS”，在使用批处理分析时非常重要。 以下内容，还可以参考E:\《汇总》中“静息态 fMRI 的数据预处理流程”这部分的讲述。 1、转换数据 dicom 格式转换为 img 文件，将以层为单位的数据转换成以全脑为单位的数据。转换时格式请选择NIfTI，可用SPM 输入面板中的DiCOM Import 模块转换，也可以采用专门的转换软件，如 MRIcovert。 2、Slice timing 校正 1 个volume 中层与层之间获取(采集)时间的差异，即纠正 slice（下译为扫描层）之间采集时间的差异。这对事件相关设计的实验尤为重要，使一个TR 中的各层获得时间一致（如都在一个TR 的开始），相当于 AFNI 中tshift 所做的工作。校正后的新文件名为：a＋原文件名。 ...
