(一)干扰引物(shRNA)设计:1、NCBI上下载基因序列2、在 sigema 网站输入基因号设计一对21 个碱基的干扰引物(上下游)3、从起始密码(ATG)下游 25bp 开始;4、GC 含量介于 40%~60%5、干扰引物至少一个在SDS区,一个在3’ UTR区6、选择脱靶率低的(二)、干扰载体构建1、引物退火(引物加水看标签X 50,弹匀,瞬离)退火体系:上游:5ul下游:5ul10X M buffer 5ulH2O 35ul水浴锅 100℃ 2min ,锅里隔夜(三)、酶切plko.1 载体1、 AgeI 酶切,反应体系:plko.1 载体4ugAgeI 2ul10X AgeI buffer 5ulH2O 39ul37℃水浴 2~3h2、切胶回收AgeI 酶切产物, 30ul 水洗脱3、EcoRI酶切,反应体系:AgeI 酶切产物30ulEcoRI 2ul10X H buffer 5ulH2O 13ul37℃水浴 2~3h切胶回收, 30ul 水洗脱,测浓度(四)、连接连接体系:T4 连接:退火引物2ul 退火引物5ul 酶切载体1ul 酶切载体1ulSolution I 5ul T4 连接酶1ulH2O 2ul T4 连接酶 Buffer 1ulH2O 2ul室温下连接4h。(五)、转化-80℃取感受态细胞于冰上融化,在1.5ml 离心管加 33ul 感受态,将连接产物加入,冰上放置30min,42℃水浴 60~90s,冰上放置2min ,加入无氨苄培养基,37℃摇床 1h,涂布在氨苄平板上,37℃, 16h。(六)、挑菌用枪头挑取5 个菌落(可送测序)扩大培养,加有氨苄的培养基,37℃过夜培养。(七)、提质粒碱裂解法是一种应用最为广泛的制备质粒DNA 的方法,碱变性抽提质粒DNA 是基于染色体DNA 与质粒 DNA的变性与复性的差异而达到分离目的。在 pH 值高达 12.6 的碱性条件下, 染色体 DNA 的氢键断裂, 双螺旋结构解开而变性。质粒DNA 的大部分氢键也断裂,但超螺旋共价闭合环状的两条互补链不会完全分离,当以pH4.8的 NaAc/KAc 高盐缓冲液去调节其pH 值至中性时,变性的质粒DNA 又恢复原来的构型,保存在溶液中,而染色体 DNA 不能复性而形成缠连的网状结构,通过离心,染色体DNA 与不稳定的大分子RNA、蛋白质- SDS复合物等一起沉淀下来而被除去。简明原理: 碱裂解法是基于DNA 的变性与复性差异而达到分离目的的。碱性使质粒DNA 变性, 再将 pH 值调至中性使其复性,复性的为质粒DNA,而染色体DNA 不会复性,缠结成网状物质,通过离心除去。1、取 5ml 菌液于离心管,12000 rpm 1min ,弃上清2、向沉淀加500 ul P1 ,震荡重悬3、加入500 ul P2 ,温和翻转6~8 次,充分裂解(...