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三科植物内生拟盘多毛孢的多样性及其分子系统学研究的开题报告

三科植物内生拟盘多毛孢的多样性及其分子系统学研究的开题报告_第1页
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精品文档---下载后可任意编辑三科植物内生拟盘多毛孢的多样性及其分子系统学讨论的开题报告摘要:拟盘多毛孢属于真菌界根霉菌门多毛菌纲,被认为是一个大的拟盘菌类群,分布广泛,不同物种具有不同的寄主,包括植物、真菌、动物等。本讨论选取三个内生拟盘多毛孢物种(Glomus irregulare、Funneliformis mosseae、Rhizophagus clarus) 进行分子系统学讨论,并对其多样性进行探究,旨在深化了解拟盘多毛孢的系统发育与分类学关系,为 better-understanding 填补真菌分子学讨论的 LACUNAE。讨论方法:此次讨论将从以下几方面进行:1. 分离筛选 - 通过真菌学实验室班组配合,从植物根部样品中分离筛选出不同的内生拟盘多毛孢物种,并进行标准化处理。2. DNA 提取 - 使用真菌基因组 DNA 提取试剂盒(QIAGEN GmbH,德国)对筛选出的拟盘多毛孢进行 DNA 提取。3. 质量控制 - 通过热循环反应仪检查 DNA 是否完好可用并对之进行量化。4. PCR 扩增 - 利用多重扩增 PCR 技术对各个内生拟盘多毛孢的同源核基因进行扩增。5. 测序和分析 - 利用高通量测序技术(Illumina HiSeq Xten)对扩增的序列进行测序,并将筛选出的不同拟盘多毛孢物种的序列进行 phylogenetic 分析、基于遗传距离的分类分析及生物信息学分析,探究拟盘多毛菌群体的多样性。预期结果:通过对三个内生拟盘多毛孢物种进行分子系统学讨论,本讨论预期可以揭示不同拟盘多毛孢物种之间的系统发育和分类学关系,并深化探究拟盘多毛孢的多样性,为真菌分子学讨论提供更加深化的了解。

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