这是我整理的老师布置的思考题,不一定齐全也不一定正确,不过可以选择性地参考下
1、DNA 提取常见问题,原因分析及其对策问题一:DNA 样品不纯,抑制后续酶解和 PCR 反应
DNA 中含有蛋白、多糖、多酚类杂质 2
DNA 在溶解前,有酒精残留,酒精抑制后续酶解反应 3
DNA 中残留有金属离子对策:1
重新纯化 DNA,去除蛋白、多糖、多酚等杂质(具体方法见前)2
重新沉淀 DNA,让酒精充分挥发 3•增加 70%乙醇洗涤的次数(2-3 次)问题二:DNA 降解
材料不新鲜或反复冻融 2
未很好抑制内源核酸酶的活性 3
提取过程操作过于剧烈,DNA 被机械打断 4•外源核酸酶污染 5
反复冻融对策:1
尽量取新鲜材料,低温保存材料避免反复冻融2
液氮研磨或匀浆组织后,应在解冻前加入裂解缓冲液3
在提取内源核酸酶含量丰富的材料的 DNA 时,可增加裂解液中螯合剂的含量4
细胞裂解后的后续操作应尽量轻柔5
所有试剂用无菌水配制,耗材经高温灭菌6•将 DNA 分装保存于缓冲液中,避免反复冻融问题三:DNA 提取量少
实验材料不佳或量少 2
破壁或裂解不充分 3
沉淀不完全 4
洗涤时DNA 丢失对策:1
尽量选用新鲜(幼嫩)的材料 2•动植物要匀浆研磨充分;G+菌、酵母裂解前先用生物酶或机械方式破壁 3
高温裂解时,时间适当延长(对于动物细胞、细菌可增加 PK 的用量)4•低温沉淀,延长沉淀时间 5•加辅助物,促进沉淀 6
洗涤时,最好用枪头将洗涤液吸出,勿倾倒2、猪肝脏总 RNA 的提取
RNA 提取常见问题,原因分析及其对问题一:RNA 的降解(1)新鲜细胞或组织的 RNA 降解RNA 降解:1
裂解液的质量 2•外源 RNase 的污染 3
裂解液的用量不足4
组织裂解不充分 5
另外某些富含内源酶的样品(如脾脏,胸腺等),很难避免