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收藏级资源肿瘤数据库汇总

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收藏级资源|肿瘤数据库汇总现如今,随着人们生活方式和环境的改变,恶性肿瘤已经成为疾病死亡病因之一。肿瘤在全球呈现发病率增高,以及发病年龄年轻化的趋势。2025 年,A Cancer Journal For Clinicians 杂志发布了最新的数据。该报告估量,2025 年美国将有 1,762,450 例新的癌症病例和 606,888 例与癌症相关的死亡。传统化疗是对抗癌症的常见方法,但它会攻击全身,造成不必要的副作用,如脱发,恶心和疲劳。靶向治疗选择性地杀死癌细胞而不影响健康组织。靶向药物开发将成为治疗癌症的重要手段。图 1 肿瘤靶向治疗高通量检测技术迅速进展,使得与肿瘤相关的组学数据迅速积累。这些数据对于讨论肿瘤的发生进展机制具有重要意义。对数据的挖掘能够确定许多与疾病有关的基因,为治疗和发病机制的讨论提供新的思路。如何有效利用和存储这些信息就显得尤为重要。肿瘤的生物信息学数据库的建立提供了有效的解决方案,对肿瘤基础讨论的进展、临床治疗水平的提高具有极大的推动作用。以下是一些肿瘤相关的数据库分类和大致的信息。1. 综合性肿瘤数据库 2. 肿瘤基因组数据库 3. 肿瘤 DNA 甲基化数据库 4. 肿瘤转录组数据库 5. 肿瘤蛋白组数据库 6. 肿瘤相关基因的数据库 7. 肿瘤与药物数据库 1. 综合性肿瘤数据库综合肿瘤数据库汇总如表 1 所示。表 1 综合性肿瘤数据库DatebaseDescriptioncanEvolveWeb portal for integrative oncogenomicscBioPortalcBioPortal for Cancer GenomicsCGAPCancer Genome Anatomy ProjectCGHubCancer Genomics HubCGWBCancer Genome Work BenchCOSMICCatalogue Of Somatic Mutations In CancerICGC International Cancer Genome ConsortiumTCGA The Cancer Genome AtlasUCSC Genome BrowserUCSC Cancer Genomics Browser以下是对数据库的简要概述1.1 canEvolve [1]canEvolve 存储的信息包括:基因、microRNA (miRNA)和蛋白质表达谱、多种癌症类型的拷贝数变化(CNAs)以及蛋白质-蛋白质相互作用信息。1.2 cBioPortal for Cancer Genomics (cBioPortal) [2]cBioPortal for Cancer Genomics 是一个癌症基因组数据探究、可视化及分析平台,可用于多个癌症基因组学数据集的交互式探究。该数据库可提供 CNA、基因突变信息。针对每个基因,它可给出多个信息,主要包括:基因的 CAN 信息、基因突变在样本中的分布、突变位点和频率、共表达基因...

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