蛋白质组学蛋白质是生物体的重要组成部分，参加几乎所有生理和细胞代谢过程。此外,与基因组学和转录组学比较，对一个细胞或组织中表达的所有蛋白质，及其修饰和相互作用的大规模讨论称为蛋白质组学。蛋白质组学通常被认为是在基因组学和转录组学之后,生物系统讨论的下一步。然而，蛋白质组的讨论远比基因组学复杂，这是由于蛋白质内在的复杂特点，如蛋白质各种各样的翻译后修饰所决定的.并且,讨论基因组学的技术要比讨论蛋白质组学的技术强得多，虽然在蛋白质组学讨论中，质谱技术的讨论已取得了一些进展。尽管存在方法上的挑战,蛋白质组学正在迅速进展，并且对癌症的临床诊断和疾病治疗做出了重要贡献。几项讨论鉴定出了一些蛋白质在乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌和食道癌中表达变化。例如，通过蛋白质组学技术，人们可以在患者血液中明确鉴定出肿瘤标志物。表 1 列出了更多的蛋白质组学技术用于讨论癌症的例子.另外，高尔基体功能复杂.最新讨论表明，它除了参加蛋白加工外,还能参加细胞分化及细胞间信号传导的过程，并在凋亡中扮演重要角色，其功能障碍也许和肿瘤的发生、进展有某种联系.根据人类基因组讨论，约 1000 多种人类高尔基体蛋白质中仅有 500~600 种得到了鉴定，建立一条关于高尔基体蛋白质组成的技术路线将有助于其功能的深化讨论。蛋白质组学是一种有效的讨论方法，特别是随着亚细胞器蛋白质组学技术的迅猛进展,使高尔基体的全面讨论变为可能。因此讨论人员希望能以胃癌细胞中的高尔基体为讨论对象，通过亚细胞器蛋白质组学方法，建立胃癌细胞中高尔基体的蛋白质组方法学。讨论人员采纳蔗糖密度梯度的超速离心方法分离纯化高尔基体,双向凝胶电泳（2—DE)分离高尔基体蛋白质，用 ImageMaster 2D 软件分析所得图谱，基质辅助激光解吸离子化飞行时间质谱（MALDI—TOF MS）鉴定蛋白质点等一系列亚细胞器蛋白质组学方法建立了胃癌细胞内高尔基体的蛋白图谱。最后,人们根据分离出的纯度较高的高尔基体建立了分辨率和重复性均较好的双向电泳图谱，运用质谱技术鉴定出 12 个蛋白质,包括蛋白合成相关蛋白、膜融合蛋白、调节蛋白、凋亡相关蛋白、运输蛋白和细胞增殖分化相关蛋白.通过亚细胞器分离纯化、双向电泳的蛋白分离及 MALDI-TOF MS 蛋白鉴定分析，讨论人员首次成功建立了胃癌细胞 SGC7901 中高尔基体的蛋白质组学技术路线。 3.1 蛋白质功能预测工具也许生物信息学方法在癌症讨论中最常用的就是基因功能预测方法，但是这...
