Illumina 与 Roche 性能比较表Illumina MiSeqRoche 454 JuniorIllumina HiSeq1000Roche GS FLX通量最高通量的个人化测序仪，自动完成从簇生成到测序到数据一级分析和二级分析每此运行可产出 300M-15 Gb 数据0.035G 数据量全球最高通量的二代测序：300G 的数据量；0。45G 碱基数据量；读长2x300bp400 bp2x100bp450bp运 行费用300-1000 美元/G 的数据量70,000 美元/G 的数据量60 美元/G 的数据量20,000 美元/G 的数据量数 据准 确性Illumina SBS 测序化学原理是二代测序技术中最被广泛证明和认同的（市场份额和发表文章数量均远超过竞争对手）数 据 质 量 不 受 Homopolymeric regions 影响>Q20 数 据 质 量 （ >80 ％ 数 据 为Q30）Q20 数据质量(假如无重复序列）焦 磷 酸 测 序 存 在homopolymer 无 法 正确读取Illumina SBS 测序化学原理是二代测序技术中最被广泛证明和认同的（市场份额和发表文章数量均远超过竞争对手）数据质量不受 Homopolymeric regions 影响>Q20 数据质量 (>80％数据为Q30）Q20 数据质量（假如无重复序列）焦 磷 酸 测 序 存 在homopolymer 无法正确读取实 验周期提供最快的二代测序的实验流程，最快可在 8 小时内完成从 DNA 样本建库到数据分析猎取全过程.流程包括：文库制备：1。5 小时，使用快速整个实验流程需要数天时间,包括：文库制备：1 天,且需要大量的手工操作ePCR+ Enrichment ： 在主机外进行,且需要大量手工操作,手动进行。文库制备：1。5 小时 Netera 快速方法和 1 天的 TruSeq 标准方法。8.5 天产生 300G 数据。整个实验流程需要数天时间，包括:文库制备：1 天，且需要大量的手工操作ePCR+ Enrichment ： 在主机外进行，且需要大量手工操作，手动进行。Illumina MiSeqRoche 454 JuniorIllumina HiSeq1000Roche GS FLXNextera（1ng 上样量)方法在一个仪器系统内、以不到 4。5 小时（1 X 36 bp)的时间完成从自动化簇生成到测序全过程在一个仪器系统内，以不到 2 小时的时间完成初级和次级分析2 X 150 bp 运行约需 24 小时2 x 250 bp 运行约需 35 小时测序：10 小时测序：10 小时应 用范围中小基因组的讨论：扩增子测序靶向重测序Clone Checking小基因组测序（de nove/重测序，〈20Mb)ChIP-Seq小 RNA 测序宏基因...
