二代测序4个平台比较illumina&Roche

Illumina 与 Roche 性能比较表Illumina MiSeqRoche 454 JuniorIllumina HiSeq1000Roche GS FLX通量最高通量的个人化测序仪，自动完成从簇生成到测序到数据一级分析和二级分析每此运行可产出 300M-15 Gb 数据0.035G 数据量全球最高通量的二代测序：300G 的数据量；0。45G 碱基数据量；读长2x300bp400 bp2x100bp450bp运 行费用300-1000 美元/G 的数据量70,000 美元/G 的数据量60 美元/G 的数据量20,000 美元/G 的数据量数 据准 确性Illumina SBS 测序化学原理是二代测序技术中最被广泛证明和认同的（市场份额和发表文章数量均远超过竞争对手）数 据 质 量 不 受 Homopolymeric regions 影响>Q20 数 据 质 量 （ >80 ％ 数 据 为Q30）Q20 数据质量(假如无重复序列）焦 磷 酸 测 序 存 在homopolymer 无 法 正确读取Illumina SBS 测序化学原理是二代测序技术中最被广泛证明和认同的（市场份额和发表文章数量均远超过竞争对手）数据质量不受 Homopolymeric regions 影响>Q20 数据质量 (>80％数据为Q30）Q20 数据质量（假如无重复序列）焦 磷 酸 测 序 存 在homopolymer 无法正确读取实 验周期提供最快的二代测序的实验流程，最快可在 8 小时内完成从 DNA 样本建库到数据分析猎取全过程.流程包括：文库制备：1。5 小时，使用快速整个实验流程需要数天时间,包括：文库制备：1 天,且需要大量的手工操作ePCR+ Enrichment ： 在主机外进行,且需要大量手工操作,手动进行。文库制备：1。5 小时 Netera 快速方法和 1 天的 TruSeq 标准方法。8.5 天产生 300G 数据。整个实验流程需要数天时间，包括:文库制备：1 天，且需要大量的手工操作ePCR+ Enrichment ： 在主机外进行，且需要大量手工操作，手动进行。Illumina MiSeqRoche 454 JuniorIllumina HiSeq1000Roche GS FLXNextera（1ng 上样量)方法在一个仪器系统内、以不到 4。5 小时（1 X 36 bp)的时间完成从自动化簇生成到测序全过程在一个仪器系统内，以不到 2 小时的时间完成初级和次级分析2 X 150 bp 运行约需 24 小时2 x 250 bp 运行约需 35 小时测序：10 小时测序：10 小时应 用范围中小基因组的讨论：扩增子测序靶向重测序Clone Checking小基因组测序（de nove/重测序，〈20Mb)ChIP-Seq小 RNA 测序宏基因...