大型真菌分子遗传连锁图谱研究进展VIP免费

大型真菌分子遗传连锁图谱研究进展刘伟肖扬边银丙*华中农业大学应用真菌研究所武汉430070AreviewofresearchadvanceofmoleculargeneticlinkagemapinmacrofungiLIUWeiXIAOYangBIANYin-Bing*TheInstituteofAppliedMycology,HuazhongAgriculturalUniversity,Wuhan430070,China大型真菌（macrofungi）中包括一些重要的食用真菌和药用真菌，在人类的经济生活中占有十分重要的地位（Chang&Miles1989）。真菌学研究是生物学研究中的一个重要分支，但对大型真菌遗传学的系统研究目前仍集中在少数分类单元中，例如子囊菌中的链孢属Alternaria、Neurospora及担子菌中的鬼伞属Coprinopsis和裂褶菌属Schizophyllum（Peeveretal.1999；Nargang&Rapaport2007；Kües2000；Clark&Anderson2004）。近年来，随着现代生物学研究技术和方法的飞速发展，真菌分子生物学研究也不断深入，在系统发育、遗传作图、基因定位、基因克隆及遗传转化等方面都有了长足的发展（Hamer&Givan1990；Zhongetal.2002；Fincham1989）。分子遗传连锁图谱（geneticlinkagemap）是基因组内反映基因以及专一性多态性DNA标记相对位置的图谱，能显示标记和基因在染色体上的相对位置，有利于更好地理解基因组结构和进化，是进行基因组系统研究的基础，也是遗传学研究的重要方向（Botsteinetal.1980；Marraetal.2004；deVosetal.2007；Manzo-Sánchezetal.2008；Xuetal.2009）。遗传连锁图谱的构建以及建立在此基础上的数量性状（quantitativetraitloci）定位成为了现代遗传学研究中的热点（Lander&Botstein1989；Liuetal.2004；Fischeretal.2004；Welteretal.2007）。1大型真菌分子遗传图谱研究的现状真菌遗传图谱的构建工作较高等动植物起步晚，研究基础相对落后，其构建方法主要参考高等动植物。构建过程包括：1）确定作图群体及亲本的组合；2）培养大量遗传标记处于分离状态的分离群；3）确定作图群体中不同个体基因型；4）选择合适的分子遗传标记；5）构建标记间的遗传连锁群。大型真菌分子遗传图谱的构建工作最早始于Kerriganetal.（1993）对双孢蘑菇Agaricusbisporus的遗传研究。随后糙皮侧耳Pleurotusostreatus（Larrayaetal.2000）、香菇Lentinulaedodes（Terashimaetal.2002；Kwan&Xu2002；Terashimaetal.2006；etal.2008）、灰盖鬼伞Coprinuscinereus（Muraguchietal.2003）、双色蜡蘑Laccariabicolor（Labbéetal.2008）、肺形侧耳Pleurotuspulmonarius（Yasuhitoetal.2009）和Amylostereumareolatum（vanderNestetal.2009）等图谱的构建工作也相继展开。据统计，目前公开发表的大型真菌遗传连锁图谱仅有14张（表1），而国内还未见有相关的研究报道。双孢蘑菇和香菇是两种重要的食用菌，也是大型真菌遗传学研究中研究比较深入的食用菌。表1大型真菌遗传连锁图谱构建情况Table1Constructionofmacro-fungigeneticlinkagemap物种Species构图群体Population遗传标记Geneticmarker连锁图谱Geneticlinkagemap参考文献Reference标记数Number覆盖长度Length(cM)连锁群数Linkagenumber平均图距Averagedistance(cM)双孢蘑菇Agaricusbisporus52RAPD、RFLP64543.811/Kerriganetal.1993103SCAR、Others7281/Callacetal.1997121RAPD、SCAR26339.55/Moquetetal.1999118AFLP、SSR、CAPS、Others3201156133.9Marieetal.2010双色蜡蘑Laccariabicolor45AFLP、RAPD、SSR、SNP294812132.76Labbéetal.2008糙皮侧耳Pleurotusostreatus80RAPD、RFLP2031000.7115.3Larrayaetal.200080RFLP、Others99106111/Parketal.2006肺形侧耳Pleurotuspulmonarius150AFLP300971125.2Yasuhitoetal.2009灰盖鬼伞Coprinuscinereus40RAPD、RFLP247134613/Muraguchietal.2003香菇Lentinulaedodes95AFLP2031956.7119.5Terashimaetal.200232RAPD、SSCP69622.4149.0Kwan&Xu200295AFLP-H1661398.4118.4Terashimaetal.200692RAPD、SSCP、SCAR289908.8113.1etal.2008Amylostereumareolatum80AFLP2041693258.3vanderNestetal.20091.1双孢蘑菇遗传连锁图谱的构建双孢蘑菇在西方国家己有300多年的栽培历史，而且对它的研究也较为深入。双孢蘑菇的担孢子多数为异核体，仅有...