真核生物的启动子由于真核生物中有三种不同的RNA聚合酶,因此也有三种不同的启动子,其中以启动子Ⅱ最为复杂,它和原核的启动子有很多不同:(1)有多种元件:TATA框,GC框,CATT框,OCT等;(2)结构不恒定
有的有多种框盒如组蛋白H2B;有的只有TATA框和GC框,如SV40早期转录蛋白,(3)它们的位置、序列、距离和方向都不完全相同,(4)有的有远距离的调控元件存在,如增强子;(5)这些元件常常起到控制转录效率和选择起始位点的作用;(6)不直接和RNApol结合
转录时先和其它转录激活因子相结合,再和聚合酶结合
(一)Ⅱ类基因的启动子和调控区Ⅱ类基因的启动子由核心元件和上游元件组成
核心元件包括TATA框和转录起始位点附近的启始子(initiator,Inr)
在起始点一般没有同源序列,但mRNA的第一个碱基倾向A,另一侧翼由Py组成(在原核启动子的CAT起始序列也有这种情况),称为起始子(initiator),一般由PY2CAPY5构成,位于-3~+5,可能提供RNApolⅡ识别
无论TATA是否存在,Inr对于启动子的强度和起始位点的选择都是十分重要的
现已分离纯化了与Inr特异结合的蛋白质因子
1.核心元件TATA框合又称Hogness框,Goldberg-Hogness框,俚语称为金砖(Goldbrick),其一致序列是:T85A97T93A85A63A83A50,常在起始位点的上游-25左右,相当于原核的-10序列
但-10是不可缺少的,而真核启动中也有的缺乏TATA框
其作用是:(1)选择正确的转录起始位点,保证精确起始,故也称为选择子(selector),当有的基因缺少TATA框时,可能由Inr来替代它的这一作用,如鼠的脱氨核苷转移酶(Tdt)基因就没有TATA框,但有17bp的Inr;(2)影响转录的速率
TATA框的8bp的保守序列一般都是由A