测序常用名词解释整理VIP专享VIP免费

高通量测序领域常用名词解释大全物种基因组大小发表时间拟南芥fArabidopsistlialianaj125Afb2000.11saliva)400Mb2002.4杨树(Popvhtst/ichoca/pa)480Mb2006.9葡萄(Vitisvinifera)490Mb2007.9小立碗(Physcomitrellapatens)480Mb2008.1番木瓜fam&jpapaya)370Mb2008.4高粱(So^humbicolor)730Mb2009.1玉塞型绍mays)2SOOMb2009,11黄瓜(Cucumber)3SOM2009J1大max)irOOMb2010.1［穗短柄草(Brachypodhimdistachyon)355Mb2010.2什么是高通量测序？高通量测序技术(High-throughputsequencing,HTS)是对传统Sanger测序(称为一代测序技术)革命性的改变,一次对几十万到几百万条核酸分子进行序列测定，因此在有些文献中称其为下一代测序技术(nextgenerationsequencing,NGS)足见其划时代的改变,同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能,所以又被称为深度测序(Deepsequencing)。什么是Sanger法测序(一代测序)Sanger法测序利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物。直到掺入一种链终止核苷酸为止。每一次序列测定由一套四个单独的反应构成，每个反应含有所有四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP)，并混入限量的一种不同的双脱氧核苷三磷酸(ddNTP)。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-0H基团，使延长的寡聚核苷酸选择性地在G、A、T或C处终止。终止点由反应中相应的双脱氧而定。每一种dNTPs和ddNTPs的相对浓度可以调整，使反应得到一组长几百至几千碱基的链终止产物。它们具有共同的起始点，但终止在不同的的核苷酸上，可通过高分辨率变性凝胶电泳分离大小不同的片段，凝胶处理后可用X-光胶片放射自显影或非同位素标记进行检测。GenomicDNA测序组装程序列测定［第二代测序技术序列组装［SOAPdenovoWl什么是基因组重测序(GenomeRe-sequencing)全基因组重测序是对基因组序列已知的个体进行基因组测序，并在个体或群体水平上进行差异性分析的方法。随着基因组测序成本的不断降低，人类疾病的致病突变研究由外显子区域扩大到全基因组范围。通过构建不同长度的插入片段文库和短序列、双末端测序相结合的策略进行高通量测序，实现在全基因组水平上检测疾病关联的常见、低频、甚至是罕见的突变位点，以及结构变异等，具有重大的科研和产业价值。什么是denovo测序A吕semblmdgenonn弓.denovo测序也称为从头测序：其不需要任何现有的序列资料就可以对某个物种进行测序，利用生物信息学分析手段对序列进行拼接，组装，从而获得该物种的基因组图谱。获得一个物种的全基因组序列是加快对此物种了解的重要捷径。随着新一代测序技术的飞速发展，基因组测序所需的成本和时间较传统技术都大大降低，大规模基因组测序渐入佳境，基因组学研究也迎来新的发展契机和革命性突破。利用新一代高通量、高效率测序技术以及强大的生物信息分析能力，可以高效、低成本地测定并分析所有生物的基因组序列。打砰成固定长度片测序名词关系Contig1ScsffoldFr^grwntRead(kn