物理学经典力学量子力学相对论处理热力学统计力学电动力学凝聚态•数字拟合,分类与回归,贝叶斯推断,蒙特卡罗方法,马尔可夫链•微分方程解析解与数值解,矩阵与数值计算•集合,拓扑学,图论,群伦,排列组合• Linux 操作系统:- Serialcomputing,-Distributedorparallelcomputing(并行计算),MPI- Linuxscripts,sed,awk-Perl,Python,Fortran,C++,Java• MySQL,PHP,Apache• Windows 视窗:MATLAB,R,Java,数学、统计学计算机科学机器 Computers令返回结云计旦Cloudcomputing构架:很多集群计算机,数据库,服务器步骤:程序刁子程序I搜寻、运算迖别:1>网格计算Gridcomputing:异构(异地.异机"异语言)资源,网绪连通.松散.全球网格论坛帖 GF)在制定标准,使用 Globus 工具包2、集群计算 Oustercomputing:同构方法:1、量子化学:Gaussian 从头算、半经验方法密度泛函分子反应动力学、带结构2、分子动力学:CHARMM 蛋白质模拟量子/经典混杂方法3、分子对接:DOCK 药物设计生物信息学 Bioinformatics•数据挖掘 datamining•机器学习 machinelearning/artificialintelligence-算法:决策树 Decisiontree, 随机森林 Randomforests, 关联式规贝 0 Associationrule, 人工神经网络 Artificialneuralnetworks, 遗传编程 Geneticprogramming, 诱导逻辑编程 Inductivelogicprogramming, 支持向 量机 Supportvectormachines, 聚类 Clustering, 贝叶斯网络 Bayesian networks,系综学习 Ensemblelearning,…•微机类计算生物生物信息医学信息经典力学,量子力分子动力学,量子化学(计算化学)应用:1. 理解:实验数据,光谱峰位置探究反应机理2. 预测:分子和材料的结构与性能辅助化学合成药物设计、催化剂设计结构-性质关系 QSPR 结构-活性关系 QSAR经典分子动力学,量子化学(计算化Restorinaforce:Lennard-Jones 势%呗=心(1+cos 卿 J))加速度 e-f/mf库仑势 7=qQ/4zrLennard-JonesVij(r)=4cHookesLaw-应用:模式识别 patternrecognition•分类 Classification,回归 Regression,…•可视化 visualization方法 Methods•信息 Informationdatabases,datamining,webtechnologies,onlinequery,sequencing,alignment,discovery,judge,•理解 Understandingimageprocessing,visualization,statistics,datafitting,modeling,•预测 Predictioninteraction,energyterms,scoringfunction,simulation,s...