二代测序技术比较Illumina_、454_、ABI_测序仪比较.docIllumina 、454 、ABI 测序仪比较 Illumina 测序仪 Illumina 公司的新一代测序仪 Genome Analyzer 最早由 Solexa 公司研发，利用其专利核心技术“DNA 簇” 和“可逆性末端终结（reversible terminator ）” ，实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina 公司于 2007 年花费 6 亿美金的巨资收购了 Solexa，就是为了促成 Genome Analyzer 的商品化。Genome Analyzer 作为新一代测序技术平台，具有高准确性，高通量，高灵敏度，和低运行成本等突出优势，可以同时完成传统基因组学研究（测序和注释）以及功能基因组学 （基因表达及调控，基因功能，蛋白/核酸相互作用）研究。 Genome Analyzer 自上市以来，已经为千人基因组计划立下了赫赫战功。今年早期，荷兰科学家利用它首次绘出女性的基因组图谱。而就在前两周，《Nature》杂志上一连出现三个人类基因组图谱：炎黄一号-第一个亚洲人图谱；第一个癌症病人图谱；第一个非洲人图谱。它们全是依赖 Genome Analyzer 完成的。哗，一下就来仨！这和第一个人类基因组图谱的 13 年形成了多么鲜明的对照。 根据去年底的数据，Genome Analyzer 已售出约 200 台，估计是市场占有率最广的。前不久，华大基因再添置了 12 台，准备放在香港和深圳的实验室，至此华大基因已经有 29 台 Genome Analyzer。而著名的麻省理工学院和哈佛大学 Broad 研究院拥有 47 台 Illumina 测序仪。众多实验室之所以选择 Illumina，看中的无疑是 Genome Analyzer 的高性价比。 上个月，Illumina 将 Genome Analyzer II 升级到 Genome Analyzer IIx，距年底实现单次运行获得 95 GB 数据的宏伟目标又近了一步。Genome Analyzer IIx 有两个核心特征：其一是更大的试剂冷却器，支持超过 100 个测序循环，进一步提升了系统的易用性和自动化；其二是全新的流动池支架，让每轮运行所得的高质量数据增加 20%。依靠系统软件和试剂的改进，Genome Analyzer IIx 现在能够支持 100 bp 以上的配对末端读长，并在每次运行中产生超过 20 GB 的高质量数据。 Genome Analyzer 技术的基本原理： 1. 文库制备 将基因组 DNA 打成几百个碱基（或更短）的小片段，在片段的两个末端加上接头(adapter)。 2. 产生 DNA 簇 利用专利的芯片，其表面连接有一层单链引物，DNA 片段变...
