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SouthernBlot实验流程(包括原理细节)VIP免费

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Sou thern Blot 实验流程(包括原理/细节) 一、DNA 的提取 人和哺乳动物细胞基因组DNA 的分离通常是在有EDTA、Sarkos y e 等一类去污剂存在下,用蛋白酶K 消化细胞,随后用酚、氯仿抽提,经RNas e 处理和纯化来提取DNA。 (1)取单层细胞,经无钙、镁PBS 洗一次,用0.25%胰蛋白酶消化,细胞悬液经PBS 洗2次,弃上清,取细胞沉淀。 (2)加入2ml 细胞裂解液(10mM Tris HCL,pH8.0,0.1mol/L EDTA,10mmol/L NaCL,1%SDS)充分混匀,加入蛋白酶K 至终浓度为0.5~1g/L、Sarkos y e 终浓度为0.5%,混匀裂解蛋白呈糊状。 (3)50℃水浴 2h,转入37℃水浴过夜,次日加入等体积饱和酚,轻轻颠倒混匀,以防止 DNA 断裂,约 3min。 12000r/min 离心 15 分钟(室温) (4)取水相,再加入等体积酚/氯仿(1:1),同样颠倒混匀,去除蛋白质 12000 r/min 离心 15 分钟(室温) (5)再重复步骤(4),再用等体积酚/氯仿(1:1)抽提一次 (6)取水相,再加入等体积氯仿,去除酚及蛋白质,颠倒混匀 12000 r/min 离心 15 分钟(室温) (7)取水相,加入2 倍体积的预冷无水乙醇,沉淀DNA,混匀-20℃放置 1 小时 12000 r/min 离心 15 分钟(室温) (8)用70%乙醇洗涤一次,按上法离心将沉淀真空干燥 10 分钟。 (9)加入RNas e A 至终浓度100mg/L,37℃水浴消化1 小时,消化污染的RNA。 (10)加入蛋白酶K 至终浓度0.4g/L、Sarkos y e 至终浓度0.5%,混匀,50℃水浴 2 小时,加入NaAC 至终浓度10mmol/L。 (11)用等体积饱和酚各抽提一次,步骤同前。 (12)吸上清,加入氯仿/异戊醇(24:1),按上法再抽一次。 (13)取水相,加入2 倍体积预冷无水乙醇,-20℃ 1 小时。 (14)取沉淀用 70%乙醇洗一次,真空干燥 10 分钟后溶于少量 TE 中,4℃贮存。 Sou thern 对 DNA 的质量要求比较高,一般来说,高质量 DNA 样品需具备以下几点: ① DNA 完整性好; ② DNA 纯度高; ③ 勿用 TE 溶解 DNA; ④ DNA 浓度不低于 0.7ug/ul,杂交需模板 DNA 约 20u g/泳道/次 二、引物设计 三、DNA 检测 1、DNA 浓度的测定 DNA 浓度用紫外分光光度计测定,核酸的光吸收值位于波长 260nm 处,蛋白质则位于 280nm,分别测定后,其 OD260/OD280 的比值应大于 1.8.低于此值,说明 DNA 中仍残留较多的蛋白质,此时可用酚、氯仿继续抽提纯化。若比值大于 1.9 表明 DNA 链破坏,断裂严重,已...

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