简述 cDNA文库构建的方法1. 1 mRNA纯化构 建 一 个cDNA文 库 的 第 一 步 是 分 离 在 某 一 给 定 的 组 织 或 细 胞 类 型 表 达 的mRNA
mRNA 仅占细胞总RNA 的 1%~ 5% ,因而需要另外的纯化技术来富集mRNA
从细胞总RNA 中分离mRNA 是根据实际上所有真核细胞mRNA 3’端有一长的伸展的腺嘌呤核苷,这个序列被称为poly(A) 尾巴,是mRNA分子特有的而其他主要RNA没 有 , poly(A)尾 通 常 有 足 够 的 长 度 因 而 能 与 人 工 合 成 的 互 补 的 寡 脱 氧 胸 苷 酸(oligo(dT) )杂交
正是这种特性使得mRNA 从 RNA 分子的混合物中分离出来
方法有三种:· 寡脱氧胸苷酸亲和层析:即分离mRNA 的标准方法,将一个寡脱氧胸苷酸( 12~18碱基)连接到纤维素的亲和层析柱法,总RNA混合物上样后,mRNA与寡脱氧胸苷酸退火
非poly(A)RNA不结合并很容易从柱子洗去
用低盐缓冲液洗柱,己结合的mRNA 很快洗脱出来
· 溶液杂交:本方案也用寡脱氧胸苷酸-纤维素,但不用层析柱,而是将基质直接加到总RNA 溶液中
退火和洗涤步骤通过离心含有RNA 沉淀的基质在溶液中完成
· 生物素标记寡脱氧胸苷酸和链霉亲和素包被磁性球珠:本方案中,一个生物素标记的寡脱氧胸苷酸酸引物在溶液中与总RNA退火,然后加入以链霉亲和素包被的磁性球珠,用磁分离器从大量溶液中分离球珠-mRNA 复全体
移去磁分离器,加入洗脱缓冲液,并重复磁性分离步骤
在无盐的状态下,寡脱氧胸苷酸引物从mRNA上解离
2cDNA的合成与克隆1
1 cDNA第一条链的合成所有合成cDNA第一条链的方法都要用依赖于RNA的 DNA聚合酶(反转录酶)来催化反应,有两个关键的因素,一个是mRNA 模板,另一个