单基因遗传病基因检测概述VIP免费

单基因遗传病基因检测主要内容现状与展望检测方案背景介绍病例分享单个基因变异引起，符合孟德尔遗传规律常显（AD）常隐（AR）X连锁（XL）Y连锁（YL）线粒体遗传致畸、致残、致死，无有效治疗方法，重在预防先天性终身性遗传性临床表型和遗传异质性定义遗传方式危害性特点发病率单一发病率低，但种类多，总发病率达2.5%。其中，全球出生人口单病累计发病率为10/1000*什么是单基因遗传病？*数据来源：http://www.who.int/genomics/public/geneticdiseases/en/index2.htmlSource:NorthCarolinaInstituteforRare,Orphan,andNeglectedDiseases机遇与挑战http://omim.org/statistics/entry单基因遗传病数目及检测机构http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/GeneTests/?db=GeneTests7693种282817310119234全球基因检测实验室分布http://www.genetests.org/常见基因检测技术方法优点缺点Array-CGH，SNPArray检测精度高、准确性高通量高检测1M以上的缺失/重复依赖已有数据库，不能发现新变异基因SNP具有种族差异（假阴性）MLPA同时检测缺失/重复一对引物检测多个位点检测已知突变基因SNP具有种族差异（假阴性）Sanger测序，PCR，qPCR明确、简单、对于已知基因或位点的检测快速有效测序的“金标准”通量低成本高需要设计引物和探针，优化反应条件等，操作较复杂NGS通量高•全面解决多基因、遗传异质性疾病、新变异位点等问题•多个个体同时检测（降低成本）准确性高•SNV、缺失/重复的检测准确性高成本相对较高，但大样本测序成本低CNV灵敏度、准确性稍低检测周期相对较长主要内容现状与展望检测方案背景介绍病例分享单基因遗传病系列产品及检测策略全基因组疾病•可对所有疾病检测•结果包括大量临床意义不明突变，难以解释•科研为主，没有用于临床•可以用于PGD、胎儿基因组等用途•费用高，周期长全基因组重测序•扩增一个性状或一个疾病的基因•检测点突变和缺失重复•发现新突变、但不能发现新基因•检测相关基因组合•临床意义明确•结果解释容易•可以发现新突变、不能发现新基因•可以检测75-85%致病突变•对整个外显子组捕获测序•发现点突变和缺失重复•可能发现临床意义不明的突变，难以解释•发现新基因单一疾病全外显子组疾病Sanger,QPCR,Panel单一疾病检测Panel疾病组合或全Panel检测全外显子组测序检测一类或一个系统疾病根据疾病类型不同设计不同的检测方案1单基因遗传病11大基因检测400+疾病，1200+基因单基因遗传病基因检测的意义•确定致病突变，精确诊断；辅助诊断•指导医疗干预或治疗；•指导预后保健；指导治疗•了解致病基因携带情况，评估患病风险；•为受检者提供建议，采取适当措施降低患病风险；风险评估•指导优生优育，避免将致病基因遗传给下一代遗传咨询技术方法目标区域捕获+新一代高通量测序技术检测技术:目标序列捕获高通量测序（主要）PCR-Sanger定量PCR验证技术:PCR-Sanger定量PCRLR-PCR特点:准确、专业、高通量、高性价比目标序列捕获高通量测序技术的优势MLPA、一代测序目标序列捕获+高通量测序更强大的检测手段？不在芯片列表上的疾病？芯片无法检测的疾病？病因不明的疾病？尚未发生的疾病？全外显子组基因检测（WES）2临床全外显子组检测内容全外显子组测序单基因病主诉相关12类疾病其他主诉无关的偶然发现ACMG推荐报道的57个基因携带者筛查22,000多个基因180,000多个exon2752个基因4000多种疾病核心内容全外显子组测序检测意义及重要性SLC26A3(D652N)先天性氯化物腹泻Bartter综合症？118个近亲生育阿拉伯裔MDD患者10个患者纠正诊断100个智力低下者及正常父母（Trios）13个个体发现denovo突变，3个XR250个各种单基因病患者，62个检测出致病突变纠正诊断检出率高全外显子组测序检测的优势是目前最综合（覆盖基因全面，性价比高）的基因检测方式之一；可能会有一些揭示受检者未来患病风险的偶然发现；可以随着知识和研究水平的提高更新结果；有发现新基因的可能。单一疾病、单一系统分析全外分析服务流程样本类型及运输要求样品类型体积/总量运输/保存血样成人不低于5ml，婴幼儿不低于2ml。EDTA或柠檬...