生物信息学软件介绍 蛋白质与酶:包括与蛋白质和酶有关的各种分析软件 名称 ANTHEPROT 时间 版本 5.0 操作平台 DOS 功能简介 蛋白序列分析软件包 ANTHEPROT 5.0,包括了蛋白质研究领域所包括的大多数内容,功能非常强大。应用此软件包,使用个人电脑,便能进行各种蛋白序列分析与特性预测,包括:进行蛋白序列二级结构预测;在蛋白序列中查找符合 PROSITES 数据库的特征序列;绘制出蛋白序列的所有理化特性曲线;在Internet 或本地蛋白序列数据库中查找类似序列;计算蛋白序列分子量,比重与各蛋白残基百分组成;计算蛋白序列滴定曲线与等电点;选定一个片段后,绘制 Helical Wheel 图;进行点阵图(Dot Plot)分析;计算信号肽潜在的断裂位点等功能。强烈推荐,所有研究蛋白的人员均应使用。分析蛋白序列所需要的 Prosite蛋白数据库 1.4 兆 与 Swiss-Prot 蛋白数据库 39 版,90 兆左右,压缩格式,含有 86′593 个蛋白序列条目,近 3000 万个氨基酸残基组成。已放在生物软件光盘中。下载后,将其放置在 ANTHEPROT 5.0 同一个目录,便可在本地使用程序的检索功能,不需联网查询。 名称 CONSENSE 时间 版本 操作平台 功能简介 CONSENSE 用于识别序列(蛋白)结构域,提高比对效率,Toggling between file formats,并从比对中获得保守序列片段 . 名称 Epitlot 时间 October 1989 版本 1.0 操作平台 DOS 功能简介 Epitlot 可以从蛋白质的一级结构预测它们的 B 细胞和 T 细胞抗原位点。本程序用 13 种不同的尺度(scales)计算和划分 flexibility,hydrophilicity and antigenicity profiles,然后利用抗原结构已知的蛋白来选择预测较为准确的尺度。T 细胞抗原决定基预测的基础是已发表的法则,那就是 algorithms focused on amphiphilic structures and characteristic sequence patterns 名称 Ez -fit 时间 November 14,1988 版本 1.1 操作平台 DOS 功能简介 Ez-fit 是一个用于分析酶动力学( enzyme kinetic)数据的 curve-fitting 程序。它是一个交互软件,它可以填充实验数据到模式方程中(fits experimental data to a variety of model equations)去。本程序专为酶动力学或受体动力学数据(enzyme or receptor kinetic data)的衰退 分析(regression analysis)而设计。它提供可靠的参数来评估和测定填充到所选择模型的数据的正确性。Ez-...