生物信息学软件介绍 蛋白质与酶:包括与蛋白质和酶有关的各种分析软件 名称 ANTHEPROT 时间 版本 5
0 操作平台 DOS 功能简介 蛋白序列分析软件包 ANTHEPROT 5
0,包括了蛋白质研究领域所包括的大多数内容,功能非常强大
应用此软件包,使用个人电脑,便能进行各种蛋白序列分析与特性预测,包括:进行蛋白序列二级结构预测;在蛋白序列中查找符合 PROSITES 数据库的特征序列;绘制出蛋白序列的所有理化特性曲线;在Internet 或本地蛋白序列数据库中查找类似序列;计算蛋白序列分子量,比重与各蛋白残基百分组成;计算蛋白序列滴定曲线与等电点;选定一个片段后,绘制 Helical Wheel 图;进行点阵图(Dot Plot)分析;计算信号肽潜在的断裂位点等功能
强烈推荐,所有研究蛋白的人员均应使用
分析蛋白序列所需要的 Prosite蛋白数据库 1
4 兆 与 Swiss-Prot 蛋白数据库 39 版,90 兆左右,压缩格式,含有 86′593 个蛋白序列条目,近 3000 万个氨基酸残基组成
已放在生物软件光盘中
下载后,将其放置在 ANTHEPROT 5
0 同一个目录,便可在本地使用程序的检索功能,不需联网查询
名称 CONSENSE 时间 版本 操作平台 功能简介 CONSENSE 用于识别序列(蛋白)结构域,提高比对效率,Toggling between file formats,并从比对中获得保守序列片段
名称 Epitlot 时间 October 1989 版本 1
0 操作平台 DOS 功能简介 Epitlot 可以从蛋白质的一级结构预测它们的 B 细胞和 T 细胞抗原位点
本程序用 13 种不同的尺度(scales)计算和划分 flexibility,hydrophilicity and antigenicity profiles,