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CyTOF以单细胞的视角重新审视生命

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CyTOF:以单细胞的视角重新审视生命 很容易想象Sean Bendall 博士被列入全美“40 Under 40”名录(每年评选 40 个在各领域有突出表现的的年轻人);他曾经在斯坦福 Nolan 实验室任助理教授,这个实验室位于美国 Palo Alto 小镇,隶属于加州蛋白质组研究中心的国家心肺和血液研究所(NHLBI)。Bendall 不愧是一个年轻人的杰出代表,他的工作深深影响了其所从事的研究领域。当今,一场新兴的运动正在生物学界悄然兴起,一系列单细胞生物学的技术不断涌现,它们正在促使科学家以全新的视角重新审视一些传统的研究领域。而Bendall 则正走在这场运动的前沿。 Fluidigm 公司的CyTOF 实验系统,不但使原来复杂的工作流程得到了简化,同时也将单细胞研究提升到了一个新的水平。基于此,Bendall 和他具有前瞻性思 维 的同事们已 经获 得了诸 多 新发 现。他们的研究对 象是人的免 疫 系统,相 对 于成 熟 的免 疫 系统,其发 育 的动态 过 程更 加的复杂,他们正在利 用 CyTOF 精 细的揭 示 这一过 程;这是CyTOF 在新领域的应 用 ,也为 该 领域提供 了一个新的研究思 路 。 图 二 、 质谱 流式 实验系统组成 在 Nolan 实验室中任职 期 间 ,Bendall 和他的同事们将蛋白磷 酸 化流式 技术与 质谱流式 技术结 合 起来。该 实验室一直 致 力 于流式 细胞技术的改 进 和相 关 单细胞检 测 方 法 的开 发 ,目 前已 经成 为 该 领域的领导 者 。 图 一、 Sean Ben dall 博士 通过将蛋白质组学和高级数据分析方法有机结合,这个实验室成功的对在正常和病变细胞信号通路进行了研究,这种研究方法是革命性的。Bendall 从他在 Nolan 实验室的这段时间中获取了很多灵感,并把这些灵感用于自己的新实验室中。目前,两个实验室仍然密切合作,并共享着他们的 Cy TOF 系统。目前,Bendall 的实验室隶属于斯坦福大学病理系,位于斯坦福血液中心,在这里他重点研究人类造血和免疫系统,以及在健康或者病理(癌变,过敏和自身免疫性疾病)条件下的信号调控机制。 图三、利用CyTOF 对骨髓的信号通路分析(SPADE 分析) 于此同时,NHLBI 和斯坦福的跨学科合作也正在进行中,他们已经在肺动脉高压(PAH)和自身免疫性疾病等领域开展了四个研究项目。他们的合作正好顺应了基因组学和蛋白质组学日益融合的大趋势。Bendall 解释说,基因组数据具有很宽的覆...

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