精品文档---下载后可任意编辑B 型烟粉虱免疫虫生真菌和双生病毒机制的转录组学讨论的开题报告一、讨论背景与意义烟粉虱是重要的入侵性农业害虫,它能够危害多种作物的生长发育和产量,给农业生产带来巨大的经济损失
传统的化学药剂治理有限,而生物防治成为治理烟粉虱的重要途径之一
其中,真菌和双生病毒在烟粉虫生物防治中得到了广泛应用
但是,烟粉虫对生物防治的耐受性及适应机制的讨论还比较基础,需要进一步深化探究和解释
针对上述问题,我们着手开展 B 型烟粉虫免疫虫生真菌和双生病毒机制的转录组学讨论,期望可以从基因层面上揭示烟粉虫对这些防治手段的响应和适应机制,为对其进行更有效地防治提供依据
二、讨论目标与内容1、目标(1)利用 Illumina HiSeq 4000 系统对 B 型烟粉虫的转录组序列进行测序和分析,获得与其免疫虫生真菌和双生病毒相关的基因信息
(2)结合转录组数据和生物信息学方法,挖掘出参加烟粉虫免疫虫生真菌和双生病毒防治的差异表达基因,并进行 GO、KEGG 通路富集分析解析其生物意义
(3)将转录组数据与其他信息(如蛋白质互作等)进行整合和分析,建立烟粉虫-真菌/双生病毒的网络调控模型
2、内容(1)烟粉虫的 RNA 提取,RNA 测序和质量分析
(2)对测序数据进行质控和去除低质量 reads、接头序列和序列污染
(3)将测序结果进行拼接和组装,生成烟粉虫的转录组序列
(4)利用 GO、KEGG 等工具对差异表达基因进行生物信息学分析和解析
(5)结合其他信息并进行系统分析,建立烟粉虫-真菌/双生病毒的网络调控模型
精品文档---下载后可任意编辑三、讨论预期结果1、获得 B 型烟粉虫的转录组序列和基因信息
2、挖掘烟粉虫对真菌/双生病毒防治的响应和适应机制
3、建立烟粉虫-真菌/双生病毒的网络调控模型,为生物防治提供理论基础和参考模型
4、丰富烟粉虫抗逆性和应激应对