精品文档---下载后可任意编辑不同品种猪感染圆环病毒Ⅱ型后肺组织差异 miRNA的鉴定及功能分析中期报告本项目旨在通过比较不同品种猪感染圆环病毒Ⅱ型后肺组织的miRNA 表达谱差异,进一步了解 miRNA 在猪圆环病毒Ⅱ型感染中的作用及机制。本中期报告主要是对实验进展和结果的简要介绍。1.实验进展1.1 队列设计本项目共涉及 4 个处理组和 1 个对比组,其中 4 个处理组分别是黑猪、长白猪、杜洛克猪和皮特兰猪感染圆环病毒Ⅱ型后肺组织,对比组为未感染的正常猪肺组织。1.2 样品采集使用 4 周龄的猪,分别在各个处理组和对比组进行采样。处理组的样品经过病毒感染后,在感染后 24h 进行采样,并与对比组样品进行对比。采纳 RNA 后组学技术对样品进行 miRNA 测序,并猎取 miRNA 的表达谱。1.3 数据分析利用 R 语言进行统计分析,分析 miRNA 表达谱差异,并通过 GO分析和 KEGG 通路分析等手段,将 miRNA 与相关通路和功能进行联系。2.实验结果2.1 miRNA 筛选通过对 miRNA 测序数据的分析,共筛选出不同表达 miRNA 190 个,其中 170 个 miRNA 表达量上调,20 个 miRNA 表达量下调。经过进一步筛选可得到 DE-miRNA 列表。2.2 miRNA 功能分析通过 GO 和 KEGG 通路分析,得到了 miRNA 在免疫调节,代谢过程等多个方面的相关通路和功能。结果表明,在猪圆环病毒感染后,miRNA 通过影响免疫和代谢等生物过程,参加圆环病毒感染的进展和肺组织的病理过程。3.结论精品文档---下载后可任意编辑本中期报告报道了对不同品种猪感染圆环病毒Ⅱ型后肺组织 miRNA表达谱差异的筛选及功能分析。结果表明,miRNA 在猪圆环病毒感染后,通过影响免疫和代谢等重要生物过程,参加圆环病毒感染的进展和肺组织的病理过程。