检索系统的简介

精品文档---下载后可任意编辑Entrez 检索系统是储存和分析关于分子生物学、生物化学和遗传学知识的自动化系统, 是美国国家生物技术信息中心(National Center for Bio technologyInformation, NCBI) 网站http:// www. Ncbi. nlm. nih. gov/建立的最受欢迎的检索系统之一，它允许用户从 NCBI 整合的多个数据库中同时检索文献题录和分子生物学数据。Entrez 系统中的数据库均有同样的检索界面, 遵循相同的检索规则。这些数据库包含:PubMed: 生物医学文献数据库Nucleotide: 核酸序列数据库, 包括 GenBank, RefSeq,和 PDB 中的序列数据Protein sequence database: 蛋白质序列数据库, 包括来自 SwissProt, PIR, PRF, PDB, 以及自GenBank and RefSeq 解码转译的数据Structure: 大分子三维结构数据库Genome: 完整的基因组数据, 包括已经完成基因组测序和正在进行基因组测序的 800 多种生物体;PopSet: 人口讨论数据集, 指已搜集到的分析人类进化关联的 DNA 序列集OMIM: 人类孟德尔遗传数据库Taxonomy: GenBank 中的物种分类学数据库Books: 在线生物医学图书ProbeSet: 基因表达和微阵列数据集3D Domains: Entrez Structure 中特定功能域的三维结构UniSTS: 标记物和遗传学图谱数据(mapping data)SNP: 单核苷酸多肽性数据库1．Entrez 系统的检索1.1 Entrez 检索的基本原理索词被作为主题词和文本词分别检索，并自动形成相应的检索式。1. 1.1 基本检索:是文献检索查全率的基本方法 自由词检索:进人 PubMed 检索主页面.检索字段为所有字段，在检索框内键人一个或多个检索词语，按 Enter 或点击 c>o 按钮。 截词检索:也是在所有字段检索的方便方法，它只适用于单词，检索格式是“X*”,X 表示一个词的开始部分。如:"immunoglob*”就会检索出 immunoglobulin ,immunoglobulins, immunoglobin,and immunoglobins 等。. 2 高级检索:主要用于提高文献的查准率 逻辑组配检索:逻辑组配使用大写的布尔逻辑运算符 AND,OR,NOT 将检索词连接形成检索式进行检索。 预览/索引检索:在预览/索引页面的文本框进行多个词语的添加，再点击运算符，就可组配检索。点击预览/索引的预览选择历史记录将显示最新连续检索的三个结果，提供观察检索策略的相互影响。 限定检索假如检索结果过多，可采纳限定检索范围。Entrez 的不同数据库因记录内容不同，各限定检索的条件也将随之而变。PubMed 的限定(...