“烟草cDNA文库构建及重要基因表达谱研究”项目评标情况-VIP免费

附件9“烟草cDNA文库构建及重要基因表达谱研究”项目评标情况一、招标要求1．项目意义建立烟草cDNA文库，获得大量的EST和全长cDNA序列是开展烟草功能基因研究的重要前提，是实施烟草基因组计划重大专项的基础性工作，将为烟草分子育种奠定基础。今年针对“烟草cDNA文库构建及重要基因表达谱研究”项目进行招标攻关，一是先期开展相关技术研究，为全面启动烟草基因组计划重大专项积累必要的技术、人才基础，二是通过项目招标，引导行业内外科研院所加大烟草遗传育种基础研究力度，推动烟草育种工程的顺利实施。目前美国、欧盟等先后开展了不同烟草品种的EST测序，并已获得了一定数量的烟草EST数据，但我国在烟草重要功能基因表达调控、代谢网络等分子水平的基础还相当薄弱。因此，充分利用我国的种质资源，建立不同种质在逆境诱导、不同发育时期以及不同组织器官的cDNA文库，分离克隆与烟草生长、发育、1抗逆、抗病、品质等有关基因的全长序列、调控因子以及特异启动子，研究其表达模式，进行基因表达产物分析、转基因功能验证及生理遗传学分析，对于确定基因功能，进而分析这些基因在烟草遗传改良中的利用价值和途径具有重要意义。2．研究内容（1）烟草cDNA文库的构建及测序。构建普通烟草不同组织、不同时期的全长cDNA文库；构建逆境诱导的特异组织的全长cDNA文库；构建特定烟草品种（品系）特定组织的全长cDNA文库；挑选克隆并进行测序。（2）基因挖掘与生物信息学分析。对测序数据进行拼接，对非重复全长cDNA序列进行功能注释和功能分类及代谢网络分析；建立烟草不同时期的基因表达谱以及全长cDNA序列的检索和比对数据库。（3）重要功能基因研究。利用生物信息学分析得到的相关基因的表达谱信息，鉴定重要的功能基因并开展关键基因的详细表达谱研究和功能分析。3．经济技术指标（1）完成覆盖烟草重要发育时期根、茎、叶、花等不同组织器官和特殊烟草种质特异组织的全长cDNA文库30个左右。通过全长文库构建、全长克隆完全测序和数据拼接等，分离鉴定烟草的全长cDNA序列2万条左右。（2）建立烟草基因表达、检索及分析的基础数据库。2（3）分离与烟草香气、烟碱和有害物质代谢作用网络以及氮磷钾营养高效、抗病、抗旱、耐盐碱等性状相关的基因及调控因子300个以上，其中鉴定关键基因5个以上，同时进一步分析表达谱并验证其功能，获得5个以上重要基因功能验证的烟草材料。本项目的创新点在于，一是建立一批覆盖烟草重要发育时期、不同组织器官和特殊烟草种质的全长cDNA文库，建成国际上规模最大、种类最多的烟草cDNA文库，并测序获得基因全长序列；二是分析基因表达特征谱，探索在特定材料、特定时期、特定组织活跃表达且起重要作用的基因，以确定重点研究分析并具有应用前景的烟草功能基因，将使我国在烟草功能基因组研究领域在国际上占有一席之地。本项目的关键技术在于，一是通过全长cDNA文库的构建及均一化，获得高质量的全长cDNA；二是通过烟草表达基因数据库的开发，建成比较完善的烟草基因相关信息的检索平台；三是分离与烟草品质、营养性状相关的基因，并进行功能验证。二、应标情况标书序号应标单位综合评估分评标排序评标结论1主标单位：中国农业科学院烟草研究所参标单位：西南大学贵州省烟草科学研究所89.71中标候选人32主标单位：河南农业大学国家烟草栽培生理生化研究基地参标单位：中科院上海生命科学研究院植物生理生态研究所国家基因研究中心中科院遗传与发育学研究所86.72中标候选人3主标单位：武汉大学参标单位：上海联众科技研究院司64.710/4主标单位：上海人类基因组研究中心参标单位：河南省农业科学院烟草研究中心72.85/5主标单位：广州大学参标单位：中国烟草中南农业试验站76.04/6主标单位：中国烟草总公司郑州烟草研究院参标单位：中国农业科学院生物技术研究所中科院武汉病毒研究所72.76/7主标单位：黑龙江省烟草科学研究所参标单位：上海市农业科学院中国农业科学院生物技术研究所黑龙江八一农恳大学70.37/8主标单位：北京华大烟草基因研究开发中心参标单位：北京华大基因研究中心中科院北京基因组研究所山东省烟草专卖局82.23中标候选人9主标单位：福...