蛋白質組學之尖端——多肽陣列技術後基因組時代蛋白質組學研究的尖端技術
2003年,天馬藥業兩位科學家利用多肽陣列技術在全世界率先破譯SARS全部特異性表位,可用于開發高準確度的檢測試劑和相關疫苗
此項技術並可用于包括HIV在内的各種傳染病的疫苗開發
技術簡介多肽陣列是一種新型生物晶片,是後基因時代揭示各種疾病和生化現象的最直接的研究技術
該技術平臺主要包括PEP-OVERLAP、PEP-REPLACE和PEP-HIT
通過該技術平臺的軟體設計系統和自動化設備,可以將任意設計的氨基酸序列—多肽,在經過特殊處理的晶片上予以高密度地原位合成,每張晶片可承載幾千個甚至更多的原位合成多肽
該陣列技術可以根據已知蛋白的氨基酸序列,按序列漂移原則在晶片上原位合成多肽氨基酸序列,或者也可以根據待測物質的結構任意合成氨基酸序列,並將這些多肽按一定次序高密度地排列在晶片上,然後將測試物質(如抗體、血清、靶蛋白等)和晶片反應,經過免疫或反射等檢測技術發現與測試物質有結合反應的位點/域;同時,結合反應的資料可以輸入電腦進行三維結構處理,從而尋找到蛋白質與測試物質的結合部位
另外,該技術可以根據目標蛋白質設計多肽抑制物或激動劑,使得新藥發現的過程大為縮短
多肽陣列技術的主要特點包括:1
高密度、高通量:可同時測定上萬個蛋白-多肽生化反應;2
高特異性:深層揭示蛋白結合機制,準確定位抗體特異表位元和蛋白結合區域;3
成本低、週期短、操作簡單:基於化學合成的多肽陣列晶片成本為基於生物培養的抗體晶片、全蛋白晶片的數百分之一;4
準確可靠(純度穩定、結果明確、直觀、易分析)
利用PEP-OVERLAPArray技術,可以根據已知蛋白的氨基酸序列,按序列漂移原則在晶片上原位合成多肽氨基酸序列,然後和其他物質(如抗體、血清、靶蛋白等)反應,能夠檢測該蛋白質與其他物質的結合域/位點(例如:表位原-抗體、蛋白-蛋白