化学与生物学新的前沿交叉领域——化学蛋白质组学ANewIntersectionalFrontierOfchemistryandBiology——ChemicalProteomics摘要:在过去的十年里,许多种生物的DNA序列测定使我们开始有机会看到从一个完整基因组表达的所有蛋白质产物。蛋白质组学正面临着阐明这些蛋白质在正常和病理过程中的细胞功能的任务。然而,我们却面临着基因表达的多样性和复杂性的带来的困难。因此,需要可以直接对蛋白质活动进行直接定量检测的方法来揭示蛋白质在生理和病理事件中的功能。一个被称作化学蛋白质组学(Chemicalproteomics)的新的研究领域就是在这种情况下产生的,化学反应组合的选择性可以对特定的蛋白质或蛋白质集合进行标记、纯化和分析。因此,这种技术有助于发现新的具有酶活性的蛋白质,还可能加速新药靶点的发现。我将在这篇文章中简要综述化学蛋白质组学的研究进展。关键词:化学蛋白质组学;化学探针;研究进展;Abstract:Inthepastdecade,DNAsequencingofmultipleorganismshasprovideduswithoppurtunitiestolookatcompletelistsofproteinproductsexpressedfromawholegenome.Thefieldofproteomicsisnowchallengedwiththetaskofelucidatingthecellularfunctionsoftheseproteinsinbothnormalandpathologicalpro-cesses.However,wearestuckedwiththevariationsandcomplicationsofthegeneexpression.Thus,methodsthatallowdirectquantificationofproteinactivitiesratherthansimpleabundancearerequiredtouncoverdistinctproteinfunctionsinphysiologicalandpathologicalevents.AnewresearchfieldcalledChemicaolproteomics(oractivity-basedproteomics)hasbeencreatedinthissituation.Theselectivityofthechemicallyreactivegroupallowsspecificproteinsorproteinsubsetstobetagged,purified,andanalyzed.Asaresult,thistechniqueisabletoidentifynovelenzymaticproteinsandhasthepotentialtoacceleratethediscoveryofnewdrugtargets.IwillbrieflysummerizesomeadvancesintheresearchofChemistrypromeoticsinthispaper.Keywords:chemicalproteomics;chemicalprobep;researchadvances众所周之,化学是一门基础的自然科学,应用十分广泛,目前,化学正在不断地与其它学科领域发生交叉,产生一些新的研究方向,而生物学,作为研究生物的结构、功能、发生和发展的规律,与化学有着密不可分的关系。化学与生物学交叉产生的生物化学因其研究生命化学本质的内容,至今仍是生物学研究的基础分支科学之一。近年来,随着人类基因组测序的完成,人们发现基因的表达方式错综复杂,同样的一个基因在不同条件、不同时期可能会起到完全不同的作用。人们越来越发现基因组学不能回答人类关于生命活动的许多问题,而蛋白质才是基因功能的实施者,了解蛋白质的结构、定位和蛋白质与蛋白质相互作用和蛋白质的功能则明显更有利于我们了解生命现象的本质。这便是蛋白质组学(promeotics)。1/6[1]与传统的蛋白质研究技术不同的是蛋白质组学应用高通量的新技术手段、通过系统性、整体性和相互了解的新视角来研究基因组表达的蛋白质及其翻译后修饰以便得到生物体生理病理和信号转导过程的功能整合信息。而蛋白质组学的研究很大程度上要靠实验技术的发展推动,化学与生物学的一个新的交叉领域——化学蛋白质组学(ChemicalProteomics)就此产生。本文将从三个方面综述目前国际上关于化学蛋白质组学研究的新进展。包括什么是化学蛋白质组学、化学蛋白质组学的主要研究内容及所用到的技术手段、化学蛋白质组学的在新药开发中的应用。一.什么是化学蛋白质组学作为一个与基因组相伴随的概念,在特定细胞、组织或有机个体内表达的蛋白质的集合被称作蛋白质组(proteom)。因此,蛋白质组学是用来解释蛋白质组内的所有蛋白质的的功能、结构和作用规律的。在进行蛋白质组学这一颇具难度的研究时,科学家们开发出了很多先进的手段,其中一个就是化学蛋白质组学。目前,学术界对于化学蛋白质组学尚没有一个统一的定义,但通常认为,化学蛋白质组学是一个利用体内和体外化学探针进行探索蛋白质功能的化学生物学的分支学科...