经验|7个步骤教你找到启动子2015-11-14解螺旋解螺旋师弟对着电脑上的一大串序列发呆,小鱼问道,“师弟,你这是在格物致知吗
”“没有啦,我在想怎么把这个基因启动子找出来
”“试试用Mapviewer吧
”下面小鱼就以人的K-RAS基因为例讲述一下找基因启动子序列的具体操作步骤:1
打开NCBI的Mapviewer页面,http://www
gov/mapview/index
点击“GO”出现如下页面:3
出现下图,RAS参考序列给出了两个,序列有微小的差异,但总体来说基本相同
现在普遍采用的是“reference”那个序列
点击上述两条序列第一条序列(即12reference)对应的“Genesseq”,出现新的页面,点击下图出现的“Download/ViewSequence/Evidence”,即可下载查看序列等功能
出现的页面提示K-ras基因在染色体上的位置:6
因为启动子一般在-2000~+200区域,把页面中的参数修改一下:7
那么就得到K-ras的启动子区域,如下图: