普库检索笔记VIP免费

IST检索初学笔记NistSearch以前稍微看过，知道一点，和网友在气质版面的帖子中也进行过少量交流探讨，也听了郭相坤老师的NIST库检索的使用技巧的某些演示（第一届质谱技术网络研讨会：NIST库检索的使用技巧），现在整理一下自己初步学习有关内容，进一步来和大家交流探讨一下。NistSearch（NISTMSSearch2.0）检索提供谱库检索，图谱解析，同位素计算等多种功能，对质谱检索及解析很有帮助，非常好的质谱工具。软件的安装比较容易，放入NIST05或NIST08安装光盘，按提示一步一步操作即可。一种是在嵌入链接在安捷伦等工作站里面，一种是单独安装。内容如下：一.启动NIST检索二.NIST谱库检索（LibrarySearch）三.NIST谱图解析（MSInterpreter）四.同位素计算（IsotopeCalculator）五．需要请教网友的问题一．启动NIST检索1.从程序栏的NISTMassSpectralDatabase的MSSearchv2.0进入NistSearch1.从安捷伦的工作站的DATAANALYSIS（数据分析）的Spectrum菜单的NistSearch进入（要首先选某处的质谱图）3．从Amdis导入在Amdis的谱图上按鼠标右键，NISTLibrary----GotoNistMSSearchProgramNISTMSSearch2.0的界面：二.NIST谱库检索（LibrarySearch）1.未知物的检索可以通过按鼠标右键进行有关切换。这是NIST谱库与化学工作站链接进行检索的一种方式。其检索的匹配用正向和反向两种方法表示。质谱数据库（MSLibrary）:主谱库（Mainlib),主要EIMS库，重建谱库（replib）,保留指数库（nistri）,MS/MS谱库(nistmsms)，自建谱库等。在NIST检索的结果里有Match（正检索匹配度，derectmatch),R.Match(逆检索匹配度，reverseMatch）和Prob(概率,Probability)三个值。其中Prob的值是从假定此化合物是在数据库中，以及仅仅依赖在命中列表中的邻近命中的差别得出。它从分析用主库（Mainlib)检索的结果与一组重建质谱图（在重建谱库给出）得出。计算正向检索（标准库的峰与未知谱对照，看看谱库中是否存在与未知谱相同的参考谱图）的相似系数，即匹配概率或匹配率（匹配度）。计算反向检索（未知谱的峰与标准库对照，看看标准谱中的各质量峰是否出现在未知谱中。忽略在谱库不存在的未知谱上的峰。）的相似系数，即匹配概率或匹配率（匹配度）。在NIST检索中匹配率最大为1000（相当PBM中100）。最好的结果是999，无峰的谱图是0。一般讲，900或更高，极好匹配;800-900，良好匹配；700-800，尚可；低于600，差。对正向检索来讲，任何峰只要在未知谱或标准谱中之一出现，都会降低匹配值。对反向检索而讲，任何峰只要在标准谱出现，而未知谱中没有，也会降低匹配值。如果正向的匹配率低，反向的匹配率高，说明未知峰谱可能是混合物的谱图，或者本底干扰严重。估计保留指数EstimatedKovatsRI:Value:（例如丙二醇724iu）是从化合物的化学结构自动估计而来，稍有参考价值。而后面的文献的RI值是比较准，具有参考价值。2.通过化合物名称、CAS号、分子式，分子量，任一离子峰等信息检索在Search菜单下选择：例如输入化合物名称（Name）（EthylButyrate）例如输入CASNo683117-0任一离子峰检索（AnyPeaksSearch）选择要检索的离子及其丰度范围，按accept，Search：三.NIST谱图解析（MSInterpreter）从Tools菜单下选择MassSpectrumInterpreter进入谱图解析，即可出现谱图解析窗口。或者在结构式窗口点击右键，从下拉菜单中选择sendtomassspectruminterpreter,即可出现谱图解析窗口。或者从开始程序的MSInterpreter直接进入。谱图解析窗口如下：在下面的谱图上小红三角符号表示该化合物的分子量。拖动鼠标可以看到从分子峰到鼠标所在处丢失的质量数。点击鼠标则把该质量数标识出来。在谱图上点击右键可以看到断裂的碎片及其质量数等信息。例如71质量离子。在结构图上点击左键，可以看到断裂的碎片及其质量数（m/z,formula,loss,type等）。四.同位素计算（IsotopeCalculator）点击Tools/IsotopeCalculate出现同位素计算窗口。输入化合物分子式即可得到相应的同位素丰度。例如输入C6H12O2，可以看到：质量数丰度116100.00，1176.918191180.603271190.03082以及120,121同位素的丰度可以点击在某一质量数上点击，就可以把这个...