chapter15biomolecules：Aminoacids，peptides，andproteins.AminoacidsAminoacids,astheirnameimplies,aredifunctional.Theycontainbothabasicaminogroupandanacidiccarboxylgroup.20种氨基酸都是α-氨基酸。其中19种氨基酸含伯胺（-NH2），仅侧链基团存在差异。脯氨酸脯氨酸（（Proline）含仲胺。除甘氨酸（glycine）外，氨基酸是的α碳都是手性中心，存在异构体。在Fischer投影式中，把羧基写在上方，侧链基团写在下方，氨基在左为L型，在右为D型（表示方法与糖类似）。自然存在的氨基酸通常是L-氨基酸。HH2NCOOHHCglycine（甘氨酸）氨基酸的分类根据人体能否合成：必需氨基酸非必需氨基酸根据侧链基团的酸碱性：酸性氨基酸：侧链基团为酸性中性氨基酸：侧链基团为中性碱性氨基酸：侧链基团为碱性IsoelectricPoints(等电点)氨基酸发生分子内酸碱反应，主要以偶极离子（dipolarion）的形式存在，偶极离子又叫做zwitterion，性质（如溶于水，不溶于有机溶剂，属于高熔点的晶体物质）与盐类似。此时溶液的pH被称为氨基酸的等电点（isoelectricpoint，pI）。IsoelectricPoints(等电点)pHLowpH(protonated)HighpH(deprotonated)IsoelectricPoints(pI):Neutralaminoacid:pIpH=5.0~6.5Basicaminoacid:pIathigherpH（大于7）Acidicaminoacid:pIatlowerpH（小于4）计算方法：中性氨基酸，pI=（pKa1+pKa2）/2碱性氨基酸，pI=（pKa1+pKaR）/2酸性氨基酸，pI=（pKa2+pKaR）/2pKa1→↓pKa2→pKaR氨基酸间的反应＋Alanine(AlaorA)丙氨酸Serine(SerorS)丝氨酸↓Alanylserine(Ala-SerorA-S)氨基酸间的反应＋↓Alanine(AlaorA)Serine(SerorS)Serylalanine(Ser-AlaorS-A)链中氨基酸数目少于50时，改链被称作肽，更长的链为蛋白质。重复的-N-CH-CO-原子序列构成了蛋白质的骨架，书写时N终端总是在左端，C终端在右边。而且常用简称表示。covalentbondinginpeptidesamidebondThevoerlapofthenitrogenporbitalwiththeporbitalsofthecarbonylgroupimpactsacertainamountofdouble-bondcharactertotheC-Nbondandtherestrictsaroundit.Theamidebondisthereforeplanar,andtheN-Hisoriented180degreestotheC=O.DisulfidebondAsecondkindofcovalentbondinginpeptidesoccurswhenadisulfidebond,RS-SR,isformedbetweentwocysteine（半胱氨酸）residues.Peptidestructuredetermination利用氨基酸分析仪（aminoacidanalyzer）可以确定肽链中氨基酸的组成和含量。利用Edman降解法（Edmandegradation)，可以确定氨基酸在肽链中的连接顺序。这给肽链的人工合成提供了可能。肽的合成肽中氨基酸的排列存在具体顺序。要想让氨基酸按顺序排列，就要先把氨基酸保护起来。＋↓1，氨基转化为BOC衍生物保护2，羧基转化为酯保护3，利用DDC将保护起来的氨基酸连接起来4，用酸将衍生物BOC转化成氨基5，用碱将酯转化成羧基具体连接步骤重复该步骤，即可合成肽，甚至蛋白质。蛋白质的分类：•简单蛋白质（Simpleproteins）：仅由L-α-氨基酸组成的蛋白质，如血红蛋白，肌红蛋白。•复合蛋白质（Conjugatedproteins）：水解的最终产物除L-α-氨基酸外还有非蛋白质部分，该部分被称为辅基。如核蛋白，辅基为核酸；色蛋白，辅基为色素。按化学组成（composition）分类：按分子形状（three-dimensionalshape）分类：•纤维状蛋白质（fibrousproteins）：分子形状类似于细棒状纤维的蛋白质，如血纤维蛋白原，丝心蛋白等。•球状蛋白质（globularproteins）：分子形状类似于球状或椭球状的蛋白质，如血红蛋白，肌红蛋白等。•酶•调控蛋白•运输蛋白•防御蛋白•支撑蛋白等按生物功能（function）分类：酶（Enzymes）酶是一种在生化反应中作为催化剂的物质，通常是蛋白质。大多数酶由蛋白质部分和非蛋白质部分组成，其中非蛋白质部分被称为辅助因子（cofactor），蛋白质部分被称为脱辅酶（apoenzyme）；而辅助因子（cofactor）和脱辅酶（apoenzyme）的组合体被称作全酶（holoenzyme）。酶能够把反应物分子聚在一起，并且使它们具有合适的取向，为每一步特定反应提供适量的酸或碱。因此酶的催化效果好。蛋白质的应用Theappl...
