什么是代谢组学,如何进行研究
代谢组学(Metabonomics/Metabolomics):通过考察生物体系(细胞,组织或生物体)受刺激或扰动后(如将某个特定的基因变异或环境变化后),其代谢产物的变化或其随时间的变化,来研究生物体系的一门科学
代谢组(metabolome):基因组的下游产物,也是最终产物,是一些参与生物体新陈代谢、维持生物体正常生长功能和生长发育的小分子化合物的集合,主要是相对分子量小于1000的内源性小分子
代谢组学的特点:1)关注内源化合物2)对生物体系的小分子化合物进行定量定性研究3)上述化合物的上调和下调指示了与疾病、毒性、基因修饰或环境因子的影响4)上述内源性化合物的知识可以被用于疾病的诊断和药物筛选
研究方法运用核磁共振(NMR)、质谱(MS)、气质联用技术(GCMS)、高效液相色谱(HPLC)等技术对细胞提取物、组织提取物和生物体液,随时间变化的代谢物浓度进行检测,结合有效的模式识别方法进行定性、定量和分类,并将这些代谢信息与病理生理过程中的生物学事件关联起来,从而了解机体生命活动的代谢过程
完整的代谢组学流程包括样品采集及预处理、数据采集和数据分析及解释
样品采集及预处理2
数据采集NMR技术迄今为止,在代谢组学研究中最常见的分析工具是NMR
能够实现对样品的非破坏性、非选择性分析,满足代谢组学中对尽可能多的化合物进行检测的目标
质谱具有较高灵敏度和专属性,可以实现对多个化合物的同时快速分析与鉴定
数据分析及解释代谢组学的分析目标是对生物体系中尽可能多的内源性代谢组分进行无偏差的定性定量测定,整个分析过程应尽量保留生物样品中代谢物的整体信息
报告基因,报告基因与转录调节的关系
报告基因(reportergene)是一种编码可被检测的蛋白质或酶的基因,也就是说,是一个其表达产物非常容易被鉴定的基因
把它的编码序列和基因表达调节序列相