Illumina HiSeq 2000 Illumina Hiseq 2000 测序系统是一种高通量测序技术，其测序原理和Illumina Genome Analyzer II测序系统相似，仍然是采用可逆终止法的边合成边测序技术。 这种测序技术通过将基因组DNA 的随机片断附着到光学透明的表面，这些DNA 片断通过延长和桥梁扩增，形成了具有数以亿计cluster 的 Flowcell，每个cluster 具有约1000 拷贝的相同DNA 模板，然后用4种末端被封闭的不同荧光标记的碱基进行边合成边测序。这种新方法确保了高精确度和真实的一个碱基接一个碱基的测序，排除了序列方面的特殊错误，能够测序同聚物和重复序列。 这种技术避免了像传统测序技术那样耗费大量人力、物力进行片段克隆、转化、质粒抽提等繁琐的操作。而且多种样品制备方法使此技术有一系列的广泛应用，包括基因表达、小RNA 的发现，蛋白质核酸相互作用等。 HiSeq 2000 测序系统是前所未有的高通量测序系统，不仅提高测序通量，降低了成本，而且具有创新的用户体验。预先配置、即插即用的试剂，简单的流动槽上样，简单的触摸屏用户界面，这种人机交互设计特征以及轻松的测序流程，使操作更简单，更方便。 HIseq 2000 cBot Flowcell Cluster Image 测序实验流程： • 基因组DNA 打断； • DNA 末端修复； • 连接接头； • DNA 片段杂交到 Flowcell 上； • DNA 模板延伸，桥式扩增； • Flowcell 制备； • SBS（ synthesis-based-sequenceing）边合成边测序； • Hiseq 上自动化测序； • 图片处理，实时分析，碱基识别； • 图片实时分析； • 变异分析； • 总结报告； 技术特点： • 每个run 平均达到200G 的数据通量，读长为2 x 100bp； • 每个run 可同时运行2 张 Flow cell, 且每张Flow cell 可进行上下两面扫描； • 采用TDI 线性扫描技术，4 个相机同时扫描； • 预先配置、即插即用的试剂，简单的流动槽上样，触摸屏式的用户界面； • 低成本：单次运行即可以～30 倍的覆盖度同时对两个人类基因组样品进行测序，或同时绘制 200 个基因表达谱。 Illumina Hiseq 2000 能够对基因组DNA 片段大规模高通量并行测序，实验时将基因组或大片段DNA随机打断成＜700 bp 的小片段（主带可为200bp、 300bp、 500bp 等），加上特定接头做成DNA 文库后直接对 DNA 片段进行单末端（Single-End）或者双末端（Paired-End）测序，不需要克隆到细菌中，可以...
